More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1770 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 173 aa  354  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.45 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  37.82 
 
 		 334 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.45 
 
 		 746 aa  84  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  36.89 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  36.89 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.08 
 
 		 738 aa  82.4  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.89 
 
 		 818 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.61 
 
 		 542 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 452 aa  81.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 		 605 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  36.97 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 1827 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 371 aa  78.6  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 4079 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 617 aa  77.8  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.52 
 
 		 406 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.52 
 
 		 406 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  35.04 
 
 		 581 aa  77.8  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.84 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.85 
 
 		 1056 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.84 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 593 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.57 
 
 		 707 aa  75.5  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1138 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 615 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  35.14 
 
 		 706 aa  74.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 349 aa  74.7  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 306 aa  74.7  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 3560 aa  74.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  33.87 
 
 		 539 aa  73.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.89 
 
 		 784 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 556 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 1276 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 582 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 499 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.3 
 
 		 706 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.07 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 927 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 376 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.2 
 
 		 471 aa  72.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.85 
 
 		 1022 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1421 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.01 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 392 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 		 458 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 352 aa  71.2  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  33.06 
 
 		 750 aa  70.9  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 260 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.36 
 
 		 1056 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 687 aa  70.5  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.05 
 
 		 1694 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  30.33 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 4489 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 747 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00551  hypothetical protein  32.8 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.276796  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  36.7 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  34.13 
 
 		 1240 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.56 
 
 		 988 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 458 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 515 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 543 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.78 
 
 		 887 aa  68.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 446 aa  68.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 297 aa  67.8  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  38.1 
 
 		 1013 aa  67.8  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  32.98 
 
 		 1979 aa  67.8  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 573 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  33.03 
 
 		 560 aa  67.4  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  67.4  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 649 aa  67  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 836 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 602 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>