More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1668 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  78.86 
 
 
421 aa  691    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  74.04 
 
 
417 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  74.35 
 
 
421 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  80.76 
 
 
421 aa  698    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  855    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  74.28 
 
 
417 aa  615  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  73.76 
 
 
404 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  52.06 
 
 
415 aa  425  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  42.17 
 
 
412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 
420 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  34.13 
 
 
420 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  33.89 
 
 
420 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  35.01 
 
 
420 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  34.47 
 
 
417 aa  223  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  36.02 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3371  protein of unknown function DUF214  35.44 
 
 
417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270036  normal  0.137006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  32.15 
 
 
414 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  32.78 
 
 
413 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 
407 aa  207  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  34.94 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  32.45 
 
 
415 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  34.7 
 
 
407 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  32.53 
 
 
409 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  30.9 
 
 
410 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  32.53 
 
 
409 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32.53 
 
 
409 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  30.66 
 
 
416 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4288  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 
412 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  33.65 
 
 
409 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.98 
 
 
411 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4298  hypothetical protein  32.77 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0935094  normal  0.789322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4157  ABC transporter, inner membrane subunit  31.44 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4310  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  34.3 
 
 
409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  32.3 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  32.13 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  34.3 
 
 
409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 
400 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  31.86 
 
 
400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  30.39 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  30.9 
 
 
415 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  33.49 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
405 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  31.46 
 
 
400 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  33.01 
 
 
401 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  31.72 
 
 
400 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  32.13 
 
 
403 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  31.39 
 
 
410 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  32.37 
 
 
412 aa  177  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  28.09 
 
 
413 aa  176  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  31.83 
 
 
406 aa  176  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  30.29 
 
 
408 aa  176  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  31.53 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  29.95 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  30.95 
 
 
408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.23 
 
 
437 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 
406 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  31.09 
 
 
400 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  32.93 
 
 
410 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  31.72 
 
 
411 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  32.93 
 
 
410 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.99 
 
 
402 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30.99 
 
 
402 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  33.09 
 
 
398 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  32.13 
 
 
394 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  31.81 
 
 
401 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  31.81 
 
 
401 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  30.81 
 
 
391 aa  170  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  33.33 
 
 
405 aa  170  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  28.03 
 
 
715 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  32.85 
 
 
402 aa  170  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  31.08 
 
 
405 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  33 
 
 
656 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  29.4 
 
 
420 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.37 
 
 
410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.75 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.32 
 
 
658 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  30.92 
 
 
414 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.91 
 
 
405 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  31.44 
 
 
403 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  31.64 
 
 
409 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  30.14 
 
 
410 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  31.01 
 
 
411 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0722  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.17 
 
 
420 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  30.38 
 
 
405 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  29.4 
 
 
406 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  33.5 
 
 
657 aa  159  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.28 
 
 
653 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  27.95 
 
 
403 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  31.1 
 
 
405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  29.07 
 
 
423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  31.27 
 
 
657 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>