79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1615 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  100 
 
 		 288 aa  587  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  58.19 
 
 		 291 aa  321  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  57.84 
 
 		 291 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  50 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  44.91 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  43.25 
 
 		 291 aa  211  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  41.22 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  44.4 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  40.55 
 
 		 454 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  31.21 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  30.04 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  28.66 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  30.23 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  26.69 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  28.52 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  29.62 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  29.1 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  29.08 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  27.18 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  29.3 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  29.32 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  27.74 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  28.36 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  27.27 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  27.99 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  30.4 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  27.99 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  26.58 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  28.1 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  30.25 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  28.94 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  27.8 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  34.62 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  25.24 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  25.24 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  26.95 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  26.95 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  26.95 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  23.76 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  37.78 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  23.27 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  31.31 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  35 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  40 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  35.21 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  25.39 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  37.61 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  39.13 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  23.4 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  22.9 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1431  restriction endonuclease  37 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.45825  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  24.76 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  36.8 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  29.03 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  29.45 
 
 		 271 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  26.97 
 
 		 349 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5168  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 799 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1503  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 799 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.307536  normal  0.0187368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  31.87 
 
 		 222 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  26.32 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  27.41 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  29.35 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  32.88 
 
 		 493 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  33.88 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  31.25 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  32.74 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30.47 
 
 		 450 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  25.7 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  35.4 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  31.63 
 
 		 585 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  33.62 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  31.62 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9871  hypothetical protein  26.83 
 
 		 187 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  32.2 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0822  restriction endonuclease  28.1 
 
 		 456 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  27.78 
 
 		 128 aa  42.7  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  29.93 
 
 		 454 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>