35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1553 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  56.24 
 
 		 888 aa  1015    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 891 aa  1809    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  36.16 
 
 		 857 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  56.47 
 
 		 707 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  46.53 
 
 		 712 aa  429  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  44.2 
 
 		 688 aa  348  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  36.83 
 
 		 702 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  27.32 
 
 		 510 aa  88.2  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  24.02 
 
 		 847 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  23.46 
 
 		 854 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  26.67 
 
 		 860 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1100 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  32.89 
 
 		 882 aa  76.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1307 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  30 
 
 		 700 aa  71.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  23.63 
 
 		 863 aa  70.1  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1104 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1066 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1222 aa  66.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1205 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1086 aa  65.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1070 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1068 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1636  hypothetical protein  30 
 
 		 1058 aa  63.9  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0361894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1134 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1108 aa  63.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1154 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1148 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2545  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1120 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.960719  normal  0.0399031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  25.5 
 
 		 863 aa  60.1  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1164 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  30.17 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0618  hypothetical protein  29.01 
 
 		 673 aa  55.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  27.21 
 
 		 829 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  28.68 
 
 		 829 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>