49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1550 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  318  2e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  5.69387e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  50.32 
 
 
157 aa  154  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  47.77 
 
 
156 aa  145  1e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  52.42 
 
 
168 aa  132  2e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  47.2 
 
 
172 aa  125  2e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  46.46 
 
 
179 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  6.88301e-10  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  40.7 
 
 
171 aa  119  1e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  43.1 
 
 
151 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  39.06 
 
 
152 aa  100  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0350  hypothetical protein  42.62 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0357  hypothetical protein  42.62 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  83.6  1e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  36.54 
 
 
155 aa  79.3  2e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  34.92 
 
 
151 aa  78.2  4e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  41.28 
 
 
135 aa  76.6  1e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  31.85 
 
 
170 aa  75.9  2e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  38.46 
 
 
164 aa  73.9  8e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  33.96 
 
 
142 aa  73.9  8e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.27751e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  36.36 
 
 
169 aa  73.9  9e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  31.62 
 
 
170 aa  71.6  3e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  72  3e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  6.75932e-09 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3923  hypothetical protein  34.62 
 
 
155 aa  70.1  1e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  34.55 
 
 
169 aa  70.1  1e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  37.6 
 
 
129 aa  68.2  4e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  34.34 
 
 
151 aa  67.4  7e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3053  hypothetical protein  32.32 
 
 
151 aa  67  1e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  40.78 
 
 
144 aa  66.6  1e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1620  hypothetical protein  29.51 
 
 
171 aa  64.7  5e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3039  hypothetical protein  37.84 
 
 
139 aa  63.2  1e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.112157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0342  Protein of unknown function DUF2141  38.24 
 
 
149 aa  60.5  8e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  1.03286e-09  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08966  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  59.7  1e-08  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520558  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2825  hypothetical protein  27.27 
 
 
145 aa  59.3  2e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5428  hypothetical protein  29.57 
 
 
159 aa  58.2  4e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3918  hypothetical protein  31.78 
 
 
146 aa  55.8  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4032  hypothetical protein  31.78 
 
 
146 aa  55.8  2e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188724  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3889  hypothetical protein  26.28 
 
 
150 aa  53.9  9e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05215  hypothetical protein  30.77 
 
 
150 aa  50.8  7e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0235  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  50.8  7e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5466  Protein of unknown function DUF2141  30.25 
 
 
156 aa  50.1  1e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1661  hypothetical protein  28.39 
 
 
142 aa  49.7  2e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  2.3194e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0103  hypothetical protein  29.92 
 
 
164 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3951  hypothetical protein  29.21 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2175  hypothetical protein  30.4 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1327  hypothetical protein  24.29 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5037  hypothetical protein  36.84 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5198  hypothetical protein  38 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3440  hypothetical protein  29.03 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3749  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3636  hypothetical protein  32.73 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.0373236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>