More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1524 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
135 aa  271  2e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  5.01914e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  84.3 
 
 
133 aa  219  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.12857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  79.84 
 
 
195 aa  218  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  8.5544e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  75.97 
 
 
134 aa  212  2e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  81.67 
 
 
136 aa  205  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  72.73 
 
 
136 aa  196  1e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  75 
 
 
135 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.42274e-07  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1028  ribosomal protein S16  46.77 
 
 
208 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  39.44 
 
 
186 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  47.24 
 
 
146 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  54.43 
 
 
191 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  3.55382e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  44.64 
 
 
197 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  55.56 
 
 
89 aa  100  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  2.30838e-07 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  42.34 
 
 
119 aa  100  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  51.14 
 
 
90 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.7425e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.44012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.52128e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.6365e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.6513e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.28742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.51748e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  7.93752e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  51.9 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  53.41 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.39404e-10  unclonable  4.27046e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  47.13 
 
 
139 aa  99  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  2.09071e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  51.9 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  46.59 
 
 
90 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.23604e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  55.84 
 
 
86 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  48.86 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.932e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  47.73 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.54638e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  47.73 
 
 
90 aa  94.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  5.11359e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  52.56 
 
 
93 aa  94.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  37.84 
 
 
204 aa  94.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  49.35 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.0648e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  51.9 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
86 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.616e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
91 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  6.77791e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  48.78 
 
 
88 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  52.56 
 
 
92 aa  93.6  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 
81 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.78806e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.48464e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
192 aa  93.2  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  43.27 
 
 
188 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
81 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.69081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 
88 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 
81 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 
81 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  55.26 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  2.65446e-06  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  55.26 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  4.30382e-05  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.82163e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  42.86 
 
 
96 aa  90.5  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  2.68891e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 
85 aa  90.1  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  48.68 
 
 
90 aa  90.1  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.01615e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  52.56 
 
 
82 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  48.72 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.01445e-08  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  41.35 
 
 
183 aa  89  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf245  ribosomal protein S16  56.76 
 
 
85 aa  89.4  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00213273  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  36.15 
 
 
191 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  51.32 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  54.79 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  1.72433e-09  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 
87 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.01266e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 
88 aa  87.4  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  48.05 
 
 
81 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  8.64984e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  47.44 
 
 
81 aa  87  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  50.65 
 
 
82 aa  87  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  43.48 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  4.08452e-13  hitchhiker  5.16516e-07 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 
82 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  1.53303e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  48.68 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0117  30S ribosomal protein S16  41.67 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 
174 aa  85.1  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
168 aa  84.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  50 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  47.37 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  39.39 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.61695e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  44.3 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  3.94154e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  48.68 
 
 
152 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  44.3 
 
 
111 aa  84  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  8.4035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 
81 aa  84.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.4377e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 
82 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  2.1123e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  48.68 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
95 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  47.37 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
158 aa  83.2  1e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  47.13 
 
 
89 aa  82.8  1e-15  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.64239e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 
154 aa  83.2  1e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 
82 aa  82.8  1e-15  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.0375e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0569  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 
87 aa  83.2  1e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  49.33 
 
 
141 aa  83.2  1e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  48.68 
 
 
149 aa  82  2e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  44.16 
 
 
88 aa  82.4  2e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>