239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1484 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  98.31 
 
 
323 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  82.03 
 
 
325 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  75.93 
 
 
336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  72.2 
 
 
321 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  69.28 
 
 
325 aa  421  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  65.76 
 
 
506 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  63.39 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  63.39 
 
 
320 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  61.09 
 
 
333 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  59.32 
 
 
321 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  57.97 
 
 
321 aa  351  8e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  58.64 
 
 
321 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  58.64 
 
 
321 aa  349  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  57.77 
 
 
324 aa  347  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  57.29 
 
 
321 aa  343  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  57.29 
 
 
327 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  57.29 
 
 
321 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  57.29 
 
 
321 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  56.27 
 
 
319 aa  341  8e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  55.93 
 
 
321 aa  340  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  56.95 
 
 
321 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  56.95 
 
 
321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  52.88 
 
 
324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  56.95 
 
 
321 aa  333  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  58.98 
 
 
288 aa  315  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  53.58 
 
 
325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  53.29 
 
 
316 aa  295  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  45.05 
 
 
338 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  45.96 
 
 
340 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  50.83 
 
 
335 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  48.13 
 
 
335 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  47.67 
 
 
334 aa  241  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  44.06 
 
 
323 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  69.54 
 
 
160 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  43.01 
 
 
326 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  50.63 
 
 
323 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  72.3 
 
 
176 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  51.48 
 
 
180 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  31.03 
 
 
316 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  67.62 
 
 
112 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  73.63 
 
 
101 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  32.95 
 
 
321 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  38.97 
 
 
313 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  32.46 
 
 
319 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  32.06 
 
 
314 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  29.68 
 
 
315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  31.82 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  35.29 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  28.77 
 
 
316 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.18 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  29.97 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  31.02 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  30.98 
 
 
253 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  36.46 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  34.07 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  28.52 
 
 
322 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  54.46 
 
 
101 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  28.73 
 
 
258 aa  119  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  31.49 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  41.67 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  71.79 
 
 
81 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  34.97 
 
 
305 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  76.06 
 
 
72 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  31.48 
 
 
236 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  32.11 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  63.1 
 
 
97 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  32.09 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  42.42 
 
 
336 aa  113  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  32.09 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  29.15 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  30.37 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  32.84 
 
 
236 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  35.36 
 
 
288 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  34.41 
 
 
321 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  36.76 
 
 
241 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  33.14 
 
 
252 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  31.91 
 
 
289 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  28.81 
 
 
287 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  29.17 
 
 
287 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  31.38 
 
 
289 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  34.22 
 
 
277 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  37.67 
 
 
234 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  32.61 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  38.36 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  28.21 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  35.86 
 
 
235 aa  96.3  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  35.17 
 
 
231 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  33.95 
 
 
165 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1503  hypothetical protein  86.27 
 
 
112 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  37.5 
 
 
234 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  27.59 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  27.73 
 
 
248 aa  90.5  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  27.31 
 
 
248 aa  90.5  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  30.58 
 
 
232 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  33.33 
 
 
226 aa  89  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  32.97 
 
 
230 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  32.97 
 
 
230 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1332  protein of unknown function DUF1568  81.82 
 
 
61 aa  89  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>