73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1458 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1458  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.53934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0881  protein of unknown function DUF134  80.18 
 
 
227 aa  327  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.451175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1146  protein of unknown function DUF134  67.65 
 
 
191 aa  209  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.143872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0906  hypothetical protein  66.91 
 
 
203 aa  201  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2819  hypothetical protein  47.76 
 
 
156 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1249  protein of unknown function DUF134  43.33 
 
 
155 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.928642  normal  0.573446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0233  protein of unknown function DUF134  45.69 
 
 
154 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0435  HTH DNA-binding protein  38.57 
 
 
168 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0090  hypothetical protein  39.47 
 
 
153 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1487  protein of unknown function DUF134  40.94 
 
 
157 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0241794  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1655  hypothetical protein  41.83 
 
 
149 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00120133  hitchhiker  0.00648564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18270  predicted DNA-binding protein  42.31 
 
 
135 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042916  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0197  protein of unknown function DUF134  40.69 
 
 
148 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1147  hypothetical protein  52 
 
 
113 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1343  protein of unknown function DUF134  43.18 
 
 
157 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1957  hypothetical protein  39.06 
 
 
138 aa  101  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1340  hypothetical protein  41.09 
 
 
132 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1402  protein of unknown function DUF134  39.53 
 
 
143 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1003  hypothetical protein  53.26 
 
 
153 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1427  protein of unknown function DUF134  53.26 
 
 
153 aa  97.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0753  hypothetical protein  54.44 
 
 
91 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0886  hypothetical protein  40.6 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.799321  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_195  DNA-binding protein  47.92 
 
 
117 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0322712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0218  DNA-binding protein, putative  48.94 
 
 
117 aa  95.1  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.597835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2417  protein of unknown function DUF134  48.96 
 
 
115 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0135  hypothetical protein  46.88 
 
 
117 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0501  hypothetical protein  48.31 
 
 
94 aa  92  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2278  protein of unknown function DUF134  52.22 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  46 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3434  protein of unknown function DUF134  51.09 
 
 
94 aa  89  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1492  hypothetical protein  43.62 
 
 
130 aa  88.6  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527267  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1642  hypothetical protein  44.68 
 
 
130 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.176572  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1128  hypothetical protein  40.29 
 
 
163 aa  87  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0986  hypothetical protein  44.68 
 
 
130 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0214647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3639  hypothetical protein  47.19 
 
 
96 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2090  DNA-binding proteins-like protein  44.09 
 
 
130 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000200078  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0272  hypothetical protein  43.62 
 
 
130 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.185869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2142  hypothetical protein  39.39 
 
 
107 aa  85.1  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2281  protein of unknown function DUF134  37.8 
 
 
140 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.479687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0587  hypothetical protein  48.28 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3913  hypothetical protein  44.94 
 
 
96 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000685  HTH DNA-binding protein  53.41 
 
 
96 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1981  protein of unknown function DUF134  43.48 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.427185  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0687  hypothetical protein  45.16 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0263195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0727  hypothetical protein  47.19 
 
 
98 aa  79  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1194  hypothetical protein  41.49 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2217  hypothetical protein  39.39 
 
 
128 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1428  hypothetical protein  52.17 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814064  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1391  hypothetical protein  52.17 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0656  hypothetical protein  44.09 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0686  hypothetical protein  44.09 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3699  hypothetical protein  45.98 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0627  protein of unknown function DUF134  37.98 
 
 
127 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0635  hypothetical protein  38.71 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1150  hypothetical protein  36.96 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2279  protein of unknown function DUF134  44.94 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3018  hypothetical protein  41.84 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000905593  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0048  hypothetical protein  48.35 
 
 
98 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2571  protein of unknown function DUF134  27.84 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1410  hypothetical protein  47.3 
 
 
118 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0204  protein of unknown function DUF134  42.86 
 
 
95 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2345  protein of unknown function DUF134  40.66 
 
 
119 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2602  protein of unknown function DUF134  40.43 
 
 
103 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000947411  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0933  protein of unknown function DUF134  36.59 
 
 
103 aa  58.5  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0830  hypothetical protein  36.67 
 
 
187 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125088  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1974  putative DNA-binding protein  48.28 
 
 
72 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0556  hypothetical protein  42.42 
 
 
127 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.186851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2161  HTH DNA-binding protein  46.03 
 
 
119 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2435  hypothetical protein  42.86 
 
 
125 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337978  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0730  hypothetical protein  40.32 
 
 
124 aa  49.3  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.736425  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1763  hypothetical protein  33.71 
 
 
116 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2030  protein of unknown function DUF134  42.17 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1046  hypothetical protein  38.33 
 
 
110 aa  42.4  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442649  normal  0.956961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>