38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1359 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  72.39 
 
 
174 aa  206  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  49.46 
 
 
255 aa  177  7e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  49.43 
 
 
189 aa  170  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  55.8 
 
 
145 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  53.49 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  44.17 
 
 
177 aa  143  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  49.23 
 
 
353 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  48.51 
 
 
135 aa  124  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  48.54 
 
 
170 aa  125  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  42.86 
 
 
267 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  52.58 
 
 
171 aa  98.2  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  36.88 
 
 
288 aa  95.5  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  37.36 
 
 
265 aa  95.1  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  31.35 
 
 
188 aa  92  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  42.86 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  34.51 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  37.93 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  30.71 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  32.19 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  32.35 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  39.51 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  34.07 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  33.08 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  49.15 
 
 
213 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  31.76 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  40.28 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  34.57 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  35.53 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  23.6 
 
 
165 aa  52  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  23.17 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2170  hypothetical protein  42.37 
 
 
59 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  29.03 
 
 
329 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  29.59 
 
 
316 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  29.76 
 
 
316 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  28.75 
 
 
283 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>