63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1350 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.54 
 
 		 149 aa  204  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.87 
 
 		 166 aa  179  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  51.41 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.29 
 
 		 231 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  45.77 
 
 		 157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.77 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.05 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  37.23 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.7 
 
 		 193 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  38.05 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  33.04 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  34.21 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  36.46 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  30.46 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  29.85 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  29.85 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  30 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  33.04 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  34.81 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  29.2 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  32.26 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  32.35 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  32.18 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  27.12 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  32.89 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  26.42 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5003  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190773  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  36.21 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  26.12 
 
 		 143 aa  43.5  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  26.12 
 
 		 143 aa  43.5  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  26.15 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  33.33 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.293758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.15 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1044  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0507985  normal  0.081223 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  26.24 
 
 		 142 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  28.09 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 		 104 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 192 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  28.09 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  28.09 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  28.74 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>