15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1274 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  991  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  3.54045e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  50 
 
 
481 aa  480  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  45.93 
 
 
495 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.04621e-06  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  44.87 
 
 
484 aa  428  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  40.88 
 
 
488 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  23.37 
 
 
464 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  21.71 
 
 
446 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  22.65 
 
 
483 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  22.36 
 
 
455 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  21.07 
 
 
487 aa  78.2  3e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  21.18 
 
 
454 aa  62.4  2e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  23.19 
 
 
489 aa  58.5  3e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  22.35 
 
 
428 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  17.23 
 
 
444 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  21.8 
 
 
417 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>