275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1261 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  74.23 
 
 
502 aa  769    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  71.51 
 
 
502 aa  776    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  75.51 
 
 
497 aa  809    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  100 
 
 
502 aa  1040    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  76.17 
 
 
508 aa  816    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  45.3 
 
 
462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  43.86 
 
 
299 aa  243  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1334  CoB--CoM heterodisulfide reductase  44.04 
 
 
286 aa  239  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0564  CoB--CoM heterodisulfide reductase  44.04 
 
 
283 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1352  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.64 
 
 
285 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.472371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1326  hypothetical protein  41.11 
 
 
281 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0357  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.11 
 
 
284 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1349  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.86 
 
 
293 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.543015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.86 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.86 
 
 
295 aa  213  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  38.26 
 
 
296 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17760  heterodisulfide reductase, subunit B  37.88 
 
 
349 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0827  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.93 
 
 
334 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247627  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  38.18 
 
 
296 aa  206  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2099  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.7 
 
 
306 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0030  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.72 
 
 
317 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0323  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.57 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.557922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  39.62 
 
 
292 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0031  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.37 
 
 
317 aa  200  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  36.62 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1160  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.99 
 
 
295 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1805  hypothetical protein  37.37 
 
 
281 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0849  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.87 
 
 
294 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0688989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1701  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.72 
 
 
288 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000396629 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1195  hypothetical protein  40.21 
 
 
290 aa  193  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2316  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.59 
 
 
300 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0197  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.59 
 
 
300 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3525  heterodisulfide reductase, B subunit  38.41 
 
 
308 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0416  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.54 
 
 
302 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.373291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.42 
 
 
281 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3676  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.1 
 
 
300 aa  173  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2104  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.89 
 
 
305 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  32.98 
 
 
297 aa  167  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  31.01 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0976  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.44 
 
 
296 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.161405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0819  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.84 
 
 
294 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1542  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.67 
 
 
306 aa  162  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0167563 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0675  succinate dehydrogenase subunit C  32.17 
 
 
290 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0161488  hitchhiker  0.000830307 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2343  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.53 
 
 
305 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0634  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.3 
 
 
290 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1077  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.31 
 
 
320 aa  155  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0320251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0172  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.23 
 
 
290 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.44 
 
 
189 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.58 
 
 
294 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  33.45 
 
 
303 aa  150  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.96 
 
 
295 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.93 
 
 
291 aa  148  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  31.42 
 
 
301 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  42.22 
 
 
186 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  43.64 
 
 
193 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1251  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.96 
 
 
282 aa  143  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.684126  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  40 
 
 
186 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  32.21 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4093  hypothetical protein  31.23 
 
 
296 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.883836  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0637  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.15 
 
 
303 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  31.67 
 
 
285 aa  141  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  40.57 
 
 
213 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  29.39 
 
 
301 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  40.57 
 
 
213 aa  140  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  37.04 
 
 
194 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  39.2 
 
 
192 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  39.2 
 
 
192 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2550  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, C subunit  29.53 
 
 
303 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  31.56 
 
 
285 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2178  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.53 
 
 
303 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000377327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  37.04 
 
 
194 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.18 
 
 
282 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  36.61 
 
 
188 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  36.14 
 
 
194 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  40.79 
 
 
216 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.07 
 
 
301 aa  136  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  41.18 
 
 
182 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.75 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  29.86 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2211  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28 
 
 
303 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0339635  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  30.96 
 
 
285 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  40.94 
 
 
187 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.86 
 
 
282 aa  133  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  30.58 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.43 
 
 
297 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  38.82 
 
 
184 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.97 
 
 
304 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  29.86 
 
 
282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  39.16 
 
 
185 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  35.6 
 
 
192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2664  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.09 
 
 
276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.76 
 
 
297 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.96 
 
 
297 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  36.57 
 
 
204 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  40.54 
 
 
211 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  28.72 
 
 
300 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.42 
 
 
282 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.37 
 
 
300 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  38.82 
 
 
193 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  29.66 
 
 
296 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>