More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1237 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  100 
 
 
229 aa  477  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  75.46 
 
 
220 aa  344  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  66.2 
 
 
219 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  63.01 
 
 
220 aa  291  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  57.14 
 
 
225 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  55.3 
 
 
219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  51.61 
 
 
220 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  47 
 
 
217 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.06 
 
 
217 aa  192  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  42.59 
 
 
215 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.66 
 
 
218 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.94 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.01 
 
 
221 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  41.82 
 
 
224 aa  168  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.55 
 
 
217 aa  161  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  41.23 
 
 
218 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  38.5 
 
 
216 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.04 
 
 
217 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.04 
 
 
218 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  34.25 
 
 
220 aa  139  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  35.78 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.19 
 
 
216 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.94 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  34.9 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  35.45 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.63 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.82 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
227 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.84 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.64 
 
 
216 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 
231 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
226 aa  108  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 
225 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  34.26 
 
 
226 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.83 
 
 
222 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  33.86 
 
 
257 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  34.39 
 
 
224 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  34.23 
 
 
223 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
226 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
223 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  32.8 
 
 
225 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
229 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.81 
 
 
235 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.99 
 
 
219 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 
241 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  32.35 
 
 
227 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 
241 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  32.08 
 
 
461 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 
241 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 
257 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  36.17 
 
 
230 aa  101  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 
217 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  31.5 
 
 
272 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
241 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
241 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
241 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
241 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.01 
 
 
222 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 
231 aa  99.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  34.57 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  30.5 
 
 
272 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
209 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  35.47 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  31.8 
 
 
257 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  32.87 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.77 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  31.91 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  31.67 
 
 
223 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  35.47 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 
238 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  35.47 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  31.8 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  33.67 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.51 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  31.42 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
222 aa  92.8  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 
232 aa  92  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  29.59 
 
 
228 aa  92  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>