18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1224 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1224  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  587  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1755  hypothetical protein  98.47 
 
 
196 aa  401  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1368  hypothetical protein  40.43 
 
 
290 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0849  hypothetical protein  39.58 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0937749  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0812  hypothetical protein  35.49 
 
 
292 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.113076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4191  hypothetical protein  34.51 
 
 
284 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0915772  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0228  hypothetical protein  84.62 
 
 
97 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.939073  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0713  hypothetical protein  35.84 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.144173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  32.45 
 
 
234 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0961  hypothetical protein  44.79 
 
 
109 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000301997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3401  hypothetical protein  39.45 
 
 
136 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015929  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2177  Domain of unknown function DUF1814  27.93 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000211086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0953  hypothetical protein  25.82 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0846  hypothetical protein  26.29 
 
 
328 aa  55.8  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.22305  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2844  hypothetical protein  25.81 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000126793  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1303  hypothetical protein  24.78 
 
 
322 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.240695  hitchhiker  0.000000000778686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0827  hypothetical protein  27.89 
 
 
220 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3205  hypothetical protein  35.29 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42811  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>