210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1203 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  59.61 
 
 
1489 aa  1477  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1769 aa  3442  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  30.08 
 
 
1119 aa  176  4e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.92 
 
 
972 aa  152  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  28.4 
 
 
990 aa  150  2e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  28.83 
 
 
1550 aa  142  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  27.51 
 
 
985 aa  139  3e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  26.83 
 
 
994 aa  138  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29.15 
 
 
1881 aa  137  2e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  26.1 
 
 
3506 aa  135  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  27.23 
 
 
816 aa  129  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  25.26 
 
 
1369 aa  128  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  28.29 
 
 
1519 aa  125  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  26.34 
 
 
1055 aa  124  2e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.07 
 
 
1227 aa  124  2e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  27.44 
 
 
986 aa  123  4e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.12 
 
 
1029 aa  121  1e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.45 
 
 
1125 aa  121  1e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  28.02 
 
 
1333 aa  119  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  24.76 
 
 
650 aa  118  1e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  27.39 
 
 
1062 aa  117  2e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.85 
 
 
919 aa  115  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  25.93 
 
 
1001 aa  112  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  28.15 
 
 
1033 aa  112  8e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  25.94 
 
 
995 aa  111  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  26.09 
 
 
1180 aa  111  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  25.88 
 
 
1001 aa  109  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  25.42 
 
 
983 aa  108  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  27.22 
 
 
1004 aa  108  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.65 
 
 
1081 aa  105  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.65 
 
 
1011 aa  104  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  26.15 
 
 
1038 aa  103  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  26.78 
 
 
980 aa  102  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  29.66 
 
 
1028 aa  102  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  3.68637e-05 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  27.21 
 
 
1152 aa  101  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.01 
 
 
1285 aa  100  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  27.05 
 
 
2371 aa  99.8  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  27.05 
 
 
2366 aa  99.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  1.66918e-09 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  28.19 
 
 
2396 aa  98.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.46 
 
 
991 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  27.58 
 
 
2365 aa  97.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  27.58 
 
 
2346 aa  97.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  23.94 
 
 
1066 aa  96.3  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.07412e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  27.59 
 
 
995 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  26.75 
 
 
1053 aa  92.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.81 
 
 
926 aa  90.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  24.85 
 
 
1130 aa  90.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  25.95 
 
 
882 aa  89.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 
915 aa  89.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.65 
 
 
1322 aa  89  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  6.38249e-09 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  24.49 
 
 
2407 aa  88.6  1e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  26.94 
 
 
2003 aa  87.8  2e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  30.16 
 
 
2848 aa  86.7  4e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.5 
 
 
913 aa  86.3  5e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  24.83 
 
 
4248 aa  85.1  1e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.22 
 
 
3796 aa  85.1  1e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  24.7 
 
 
987 aa  84.3  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  24.74 
 
 
1129 aa  84.7  2e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  24.74 
 
 
1131 aa  84.3  2e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  24.38 
 
 
677 aa  83.6  3e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.25 
 
 
3790 aa  83.2  4e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.18 
 
 
1532 aa  82.8  5e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  24.87 
 
 
1131 aa  82.8  6e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  24.87 
 
 
1131 aa  82.8  6e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  24.87 
 
 
1129 aa  82.8  6e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  24.87 
 
 
1111 aa  82.4  6e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  24.87 
 
 
1131 aa  82.8  6e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  27.34 
 
 
1025 aa  80.9  2e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  23.86 
 
 
1459 aa  81.3  2e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.45 
 
 
3967 aa  80.5  3e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  25.38 
 
 
907 aa  79.3  7e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 
910 aa  79  7e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  26.97 
 
 
1508 aa  78.6  1e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  26.21 
 
 
1446 aa  78.6  1e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.76 
 
 
906 aa  77.8  2e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  4.19199e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.88 
 
 
1694 aa  77.4  2e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  23.62 
 
 
488 aa  77.8  2e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  26.05 
 
 
3954 aa  77.8  2e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  25 
 
 
1131 aa  77.8  2e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  24.15 
 
 
1177 aa  77  3e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1329  outer membrane autotransporter  24.78 
 
 
1058 aa  76.3  6e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0892684  normal  0.563685 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  27.12 
 
 
4238 aa  75.9  7e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  25.95 
 
 
972 aa  75.5  8e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  23.08 
 
 
814 aa  74.7  1e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  27.12 
 
 
4238 aa  75.5  1e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  23.02 
 
 
1325 aa  75.1  1e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  24.08 
 
 
1006 aa  74.7  2e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  22.82 
 
 
1179 aa  74.3  2e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  26.1 
 
 
6274 aa  74.3  2e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  26.43 
 
 
1012 aa  74.3  2e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  27.12 
 
 
3822 aa  74.3  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  35.29 
 
 
1172 aa  73.6  3e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  23.41 
 
 
1154 aa  73.9  3e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.48 
 
 
774 aa  72.8  5e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  25.17 
 
 
942 aa  72.8  6e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0245  Outer membrane autotransporter barrel  24.02 
 
 
2175 aa  72.4  7e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203155  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  25.63 
 
 
1056 aa  72  1e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  22.53 
 
 
2711 aa  71.2  2e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  23.58 
 
 
1458 aa  70.5  3e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  24.66 
 
 
3300 aa  70.5  3e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>