More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1172 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  100 
 
 
205 aa  413  1e-115  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  6.93632e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  78.54 
 
 
205 aa  344  6e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  78.54 
 
 
204 aa  335  3e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  78.54 
 
 
204 aa  332  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  77.56 
 
 
204 aa  331  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  72.2 
 
 
204 aa  309  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.54341e-08  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  73.66 
 
 
204 aa  307  6e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  56.22 
 
 
215 aa  244  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  51.22 
 
 
198 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  51.98 
 
 
199 aa  228  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.16421e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  51.22 
 
 
198 aa  228  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  53.2 
 
 
200 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  51.98 
 
 
199 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.88624e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  52.2 
 
 
199 aa  222  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  50.99 
 
 
199 aa  221  5e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.23966e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  50.24 
 
 
198 aa  221  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  48.29 
 
 
199 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  3.95528e-06 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  52.48 
 
 
198 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  53.85 
 
 
198 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  53.03 
 
 
198 aa  216  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  54.36 
 
 
198 aa  215  3e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  7.3919e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  52.53 
 
 
198 aa  214  6e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  52.53 
 
 
198 aa  214  6e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  52 
 
 
198 aa  214  7e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  5.3602e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  51.03 
 
 
199 aa  210  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  53.12 
 
 
198 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  48.24 
 
 
201 aa  210  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  50.5 
 
 
198 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  49.01 
 
 
204 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  51.01 
 
 
199 aa  208  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  53.12 
 
 
198 aa  208  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1836e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  50.75 
 
 
198 aa  208  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.24797e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  51.23 
 
 
199 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  9.15246e-06 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  46.94 
 
 
199 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.33419e-05 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  51.79 
 
 
198 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  52.31 
 
 
198 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  52.31 
 
 
198 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  52.31 
 
 
198 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  52.31 
 
 
198 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.12912e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  52.31 
 
 
198 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  52.31 
 
 
198 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  52.31 
 
 
198 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  52.31 
 
 
198 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  52.31 
 
 
198 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  52.31 
 
 
198 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  49.5 
 
 
199 aa  205  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  51.79 
 
 
198 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  50 
 
 
199 aa  203  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  49.25 
 
 
199 aa  202  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  49.5 
 
 
198 aa  202  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  47.74 
 
 
204 aa  201  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  48.24 
 
 
204 aa  202  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  51.79 
 
 
198 aa  201  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  51.79 
 
 
198 aa  201  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2905  recombination protein RecR  47.06 
 
 
204 aa  201  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  47 
 
 
204 aa  201  9e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  46.08 
 
 
203 aa  200  1e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  46.5 
 
 
199 aa  200  1e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0367  recombination protein RecR  51.79 
 
 
197 aa  199  2e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  1.04569e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  49.27 
 
 
197 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  49.75 
 
 
197 aa  197  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  48.5 
 
 
197 aa  196  2e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  47.74 
 
 
199 aa  196  2e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.59909e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  48.48 
 
 
199 aa  196  2e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  49.01 
 
 
222 aa  196  2e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  52.85 
 
 
219 aa  196  2e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  47.03 
 
 
201 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  48.22 
 
 
200 aa  195  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0096  recombination protein RecR  50.24 
 
 
197 aa  195  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4329  recombination protein RecR  48.78 
 
 
197 aa  195  4e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.63547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  48.48 
 
 
199 aa  195  4e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  46.46 
 
 
200 aa  195  5e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  45.45 
 
 
199 aa  194  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  51.01 
 
 
199 aa  194  7e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3420  recombination protein RecR  49.76 
 
 
197 aa  194  8e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  4.18809e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0193  recombination protein RecR  47.8 
 
 
197 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.54722e-32 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  50.51 
 
 
203 aa  194  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  4.71102e-06  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  48.48 
 
 
198 aa  193  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3201  recombination protein RecR  50.25 
 
 
205 aa  192  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.36854e-07  normal  0.489368 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  45.96 
 
 
199 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  48.48 
 
 
198 aa  192  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  49.49 
 
 
192 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  47.5 
 
 
199 aa  191  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  47.72 
 
 
199 aa  191  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  45.96 
 
 
199 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  47.72 
 
 
199 aa  191  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  51.02 
 
 
189 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0299  recombination protein RecR  48.24 
 
 
197 aa  191  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26896  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0277  recombination protein RecR  45.45 
 
 
213 aa  191  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  50.78 
 
 
189 aa  190  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  46.19 
 
 
199 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  51.53 
 
 
198 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  46.7 
 
 
202 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  48.73 
 
 
204 aa  189  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  45.45 
 
 
199 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  47.18 
 
 
200 aa  189  3e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  7.62461e-07  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  46 
 
 
199 aa  189  3e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  47.72 
 
 
199 aa  189  3e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  48.98 
 
 
197 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  45.69 
 
 
199 aa  188  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>