More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1162 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  310  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  79.19 
 
 		 153 aa  243  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  75.33 
 
 		 152 aa  236  8e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  74.67 
 
 		 152 aa  218  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  69.8 
 
 		 150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  67.83 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  58.67 
 
 		 152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  44.67 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  44.97 
 
 		 145 aa  116  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  46.36 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  39.6 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  38.96 
 
 		 212 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  40.28 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  40.41 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  40.27 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  39.07 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  38 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  34.48 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  37.06 
 
 		 208 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  34.78 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  37.67 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  37.5 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  36.67 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  33.99 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  35.21 
 
 		 207 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  36.99 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  38.26 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  35.66 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  35.66 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  34.97 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.17 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  36.36 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.17 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.89 
 
 		 287 aa  84.7  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  32.43 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.73 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.24 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  39.46 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.17 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  37.68 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.84 
 
 		 320 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  36.91 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  38 
 
 		 307 aa  80.5  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  31.79 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  34.72 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  35.14 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.67 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.86 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  33.33 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.11 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  40.56 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  35.81 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.86 
 
 		 290 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  34.18 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.89 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  34.01 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  33.57 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  35.76 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  35.37 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  32.67 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  35.25 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  32.21 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  33.79 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.89 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3680  universal stress protein  36.42 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  32.21 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.21 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>