114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1160 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  100 
 
 
445 aa  876  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  55.51 
 
 
444 aa  459  1e-128  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  1.76034e-09  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  59.35 
 
 
434 aa  416  1e-115  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  61.66 
 
 
447 aa  416  1e-115  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  60.59 
 
 
443 aa  413  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  42.96 
 
 
451 aa  319  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  40.97 
 
 
429 aa  303  3e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.209e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  38.48 
 
 
459 aa  296  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  43.6 
 
 
433 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  37.79 
 
 
463 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  36.36 
 
 
456 aa  283  4e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  39.05 
 
 
472 aa  282  7e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  42.75 
 
 
430 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  39.61 
 
 
464 aa  274  2e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  38.9 
 
 
491 aa  274  2e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  42.23 
 
 
446 aa  273  5e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  2.23757e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  41.12 
 
 
439 aa  273  5e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  37.42 
 
 
458 aa  273  5e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  37.55 
 
 
458 aa  270  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  37.25 
 
 
557 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  37.71 
 
 
438 aa  267  3e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  33.74 
 
 
496 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  36.18 
 
 
446 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  41.32 
 
 
453 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  37.39 
 
 
503 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  37.39 
 
 
560 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  37.39 
 
 
501 aa  263  5e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  37.65 
 
 
462 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  37.38 
 
 
464 aa  259  5e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  37.65 
 
 
453 aa  259  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  36.38 
 
 
488 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  41.41 
 
 
470 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  37.78 
 
 
443 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  40.48 
 
 
423 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  37.75 
 
 
524 aa  255  1e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  39.77 
 
 
465 aa  253  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  34.55 
 
 
522 aa  252  8e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  40.29 
 
 
437 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  35.84 
 
 
489 aa  252  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  37.67 
 
 
516 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  36.5 
 
 
481 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  37.5 
 
 
447 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  35.76 
 
 
473 aa  246  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  36.43 
 
 
472 aa  245  1e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  35.56 
 
 
460 aa  244  2e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  36.97 
 
 
519 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  36.28 
 
 
525 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  36.23 
 
 
508 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  36.97 
 
 
519 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  37.53 
 
 
467 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  36.6 
 
 
486 aa  243  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  36.38 
 
 
470 aa  241  3e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  35.62 
 
 
528 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  39.75 
 
 
471 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  39.51 
 
 
471 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  35.91 
 
 
452 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  38.18 
 
 
501 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  38.08 
 
 
448 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  35.56 
 
 
525 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  35.55 
 
 
501 aa  235  1e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  32.93 
 
 
490 aa  235  1e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  38.67 
 
 
452 aa  234  2e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  36.16 
 
 
501 aa  234  2e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  42.22 
 
 
425 aa  234  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  33.92 
 
 
454 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  36.84 
 
 
453 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  40 
 
 
472 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  37.59 
 
 
448 aa  232  8e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  36.04 
 
 
458 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  36.57 
 
 
455 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  36.15 
 
 
467 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  38.63 
 
 
443 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  35.21 
 
 
455 aa  223  5e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  32.72 
 
 
436 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  36.6 
 
 
500 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  34.96 
 
 
488 aa  220  4e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  36.09 
 
 
529 aa  220  4e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  34.63 
 
 
449 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  33.41 
 
 
498 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  35.81 
 
 
488 aa  213  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  39.12 
 
 
443 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  31.36 
 
 
462 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  37.29 
 
 
510 aa  201  2e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  38.55 
 
 
452 aa  199  8e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  36.83 
 
 
468 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  32.86 
 
 
437 aa  186  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  37.7 
 
 
546 aa  185  1e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  31.23 
 
 
464 aa  166  7e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  33.03 
 
 
442 aa  166  7e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  28.64 
 
 
455 aa  163  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  30.34 
 
 
464 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  32.03 
 
 
421 aa  153  6e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  29.02 
 
 
427 aa  133  7e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  31.43 
 
 
428 aa  117  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  29.23 
 
 
438 aa  116  9e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
424 aa  112  1e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  27.83 
 
 
436 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  27.64 
 
 
454 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  30.85 
 
 
447 aa  97.8  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  30 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>