25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1052 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  100 
 
 		 1171 aa  2418    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  43.4 
 
 		 1107 aa  542  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  30.34 
 
 		 1137 aa  422  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  41.42 
 
 		 926 aa  273  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  30.99 
 
 		 818 aa  155  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  29.95 
 
 		 825 aa  150  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  28.23 
 
 		 774 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  31.46 
 
 		 1056 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  27.75 
 
 		 818 aa  147  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  29.15 
 
 		 773 aa  142  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  29.62 
 
 		 816 aa  140  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  28.28 
 
 		 830 aa  140  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  29.14 
 
 		 770 aa  136  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  28.45 
 
 		 828 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  27.16 
 
 		 954 aa  119  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  28.45 
 
 		 1383 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  25.27 
 
 		 818 aa  103  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  26.13 
 
 		 1153 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  29.31 
 
 		 978 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  26.23 
 
 		 1320 aa  97.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  23.83 
 
 		 1101 aa  70.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1031 aa  68.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1142 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5025  Patatin  23.32 
 
 		 563 aa  55.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.155032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  33.67 
 
 		 391 aa  47.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>