74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1043 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1043  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1615  phosphate uptake regulator, PhoU  80.25 
 
 		 243 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.587621  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1677  phosphate uptake regulator, PhoU  80.25 
 
 		 243 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0167747  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1240  transcriptional regulator, putative  77.78 
 
 		 243 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.448444  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0973  transcriptional regulator, putative  72.61 
 
 		 243 aa  362  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0948  phosphate uptake regulator, PhoU  68.72 
 
 		 247 aa  334  9e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  67.07 
 
 		 251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0205293  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  26.32 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  25.87 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  27.86 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  27.47 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  27.36 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  24.88 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  27.54 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  23.94 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  21.76 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  22.5 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  23 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  23 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  23.12 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  23.22 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  22 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  24.77 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  21.67 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  26.7 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.54 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.7 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  25.49 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.7 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  26.7 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.7 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  25.45 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  25.45 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  26.88 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  22.93 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  25.53 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  23.44 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  23.47 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  22 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  27.05 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.36 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  25.93 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  25.37 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  26.09 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  26.09 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.36 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  25.5 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  24.53 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0745  phosphate uptake regulator, PhoU  22.93 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  25.95 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  25.31 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  26.51 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  20.4 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  25.5 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  24.24 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  22.89 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  22.86 
 
 		 222 aa  45.4  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  24.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  21.95 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  28.49 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  25.24 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  25.5 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  19.9 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  22.86 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1091  phosphate uptake regulator, PhoU  28.05 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1029  phosphate uptake regulator, PhoU  28.05 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  22.61 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  23.41 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  20.79 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  22.61 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  22.54 
 
 		 221 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 222 aa  42  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>