More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0968 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0968  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 
105 aa  200  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  5.76446e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1866  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  89.52 
 
 
105 aa  152  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.985917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0851  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  86.67 
 
 
105 aa  151  3e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.606633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0641  NADH dehydrogenase I subunit 4L  87.62 
 
 
106 aa  148  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0849  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  82.86 
 
 
105 aa  145  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.597042  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0750  NADH dehydrogenase I subunit 4L  80.95 
 
 
105 aa  139  1e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104693  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1600  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  80 
 
 
105 aa  136  9e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.847636  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.47 
 
 
101 aa  100  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2617  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain K  48.48 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.96 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.44 
 
 
101 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1371  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55 
 
 
102 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.371272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1270  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55 
 
 
102 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2578  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55 
 
 
102 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.741454  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3338  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12599  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.94 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.53 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1282  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  55 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103226  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44 
 
 
106 aa  87  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.69 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  42.86 
 
 
102 aa  85.5  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  1.18979e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1994  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0298291  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2526  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1188  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.288181  normal  0.242913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  42 
 
 
101 aa  83.2  1e-15  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.67 
 
 
102 aa  82.8  1e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  42 
 
 
101 aa  83.2  1e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
101 aa  83.2  1e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.45 
 
 
102 aa  82.4  2e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.61 
 
 
109 aa  82  2e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.41 
 
 
101 aa  82  2e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42 
 
 
101 aa  82  3e-15  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.89 
 
 
114 aa  82  3e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.78 
 
 
100 aa  81.3  4e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41 
 
 
102 aa  80.5  7e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1290  F420H2 dehydrogenase subunit K  45.92 
 
 
100 aa  80.5  8e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  7.20191e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  41.67 
 
 
99 aa  79.3  1e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.45 
 
 
101 aa  79.7  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.84 
 
 
100 aa  80.1  1e-14  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  41.67 
 
 
99 aa  79.3  1e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.89 
 
 
92 aa  80.1  1e-14  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40 
 
 
102 aa  79.7  1e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.326847 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  40 
 
 
102 aa  79.7  1e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.62 
 
 
110 aa  79.3  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.21 
 
 
99 aa  79  2e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40 
 
 
99 aa  79.3  2e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.42 
 
 
158 aa  79.3  2e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  37.25 
 
 
103 aa  79.3  2e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  41.67 
 
 
99 aa  79.3  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  37.25 
 
 
103 aa  79.3  2e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1101  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.38 
 
 
106 aa  78.6  2e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0967  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40 
 
 
102 aa  78.6  3e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0704138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2413  NADH dehydrogenase subunit K  50.51 
 
 
102 aa  78.2  3e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40 
 
 
102 aa  78.6  3e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896952  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  35.58 
 
 
105 aa  78.2  4e-14  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  39.18 
 
 
113 aa  78.2  4e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1503  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40 
 
 
102 aa  77.8  5e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0163297  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0191  NADH dehydrogenase subunit K  37.37 
 
 
101 aa  77.4  5e-14  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0807  NADH dehydrogenase I, K subunit  49.49 
 
 
136 aa  77.8  5e-14  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  40 
 
 
101 aa  77.4  6e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1032  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
102 aa  77.4  6e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  40.62 
 
 
99 aa  77  7e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2290  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  41.41 
 
 
101 aa  77  7e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  37.37 
 
 
101 aa  77  8e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  40 
 
 
101 aa  77  8e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0812  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
102 aa  77  9e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.907264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0900  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
102 aa  76.3  1e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0252714  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2803  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39 
 
 
102 aa  76.3  1e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.383978  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
101 aa  76.6  1e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  38.54 
 
 
99 aa  75.9  2e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  39.42 
 
 
104 aa  75.5  2e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0757  NADH dehydrogenase subunit K  50.5 
 
 
101 aa  75.5  2e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.588315  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  40 
 
 
103 aa  75.9  2e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1271  NADH dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
102 aa  75.5  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0495478  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2051  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37 
 
 
102 aa  75.9  2e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.48 
 
 
102 aa  75.5  2e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  40.86 
 
 
156 aa  74.7  4e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3500  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37 
 
 
102 aa  74.7  4e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1363  NADH dehydrogenase subunit K  47.47 
 
 
102 aa  74.7  4e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1326  NADH dehydrogenase subunit K  47.47 
 
 
101 aa  74.7  4e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341038  normal  0.0221651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  37.37 
 
 
101 aa  74.3  5e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0788  NADH dehydrogenase (quinone), K subunit  46.46 
 
 
102 aa  74.3  5e-13  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0860266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4136  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.48 
 
 
101 aa  74.3  6e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1726  NADH dehydrogenase subunit K  47.47 
 
 
102 aa  73.9  7e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.700117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  41.75 
 
 
104 aa  73.6  9e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  42.72 
 
 
104 aa  72.8  1e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4400  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.48 
 
 
101 aa  73.2  1e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  39.81 
 
 
108 aa  73.2  1e-12  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0157234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  39.36 
 
 
99 aa  73.2  1e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  42.72 
 
 
104 aa  72.8  1e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0938  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.54 
 
 
110 aa  72.8  1e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.508582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37 
 
 
103 aa  72.8  1e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4551  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
102 aa  72.8  1e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348577  normal  0.172733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4623  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.47 
 
 
104 aa  73.6  1e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0763865 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0553  NADH dehydrogenase I, K subunit  39.81 
 
 
108 aa  72  2e-12  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.719312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38 
 
 
128 aa  72.4  2e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.26 
 
 
99 aa  72.4  2e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  37.86 
 
 
102 aa  71.6  3e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598892  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2210  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
102 aa  72  3e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.650214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  41.75 
 
 
104 aa  71.2  4e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>