More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0953 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  73.54 
 
 		 447 aa  694    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 446 aa  913    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  68.39 
 
 		 457 aa  629  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  67.11 
 
 		 445 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  68.68 
 
 		 453 aa  622  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  68.08 
 
 		 449 aa  619  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  66.97 
 
 		 454 aa  578  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  53.19 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  53.4 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  53.69 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  52.97 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  51.77 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  54.27 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 426 aa  440  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  53.46 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  53.78 
 
 		 434 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  51.06 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  54.35 
 
 		 432 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  51.73 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  47.96 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  53.22 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  49.53 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  49.76 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  47.55 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  47.86 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  49.52 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  50.94 
 
 		 485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  51.34 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  52.82 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  51.75 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  46.42 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  49.17 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  51.64 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  50.48 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  49.09 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  48.93 
 
 		 440 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  49.51 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  47.88 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  49.4 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  47.83 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  47.55 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  52.3 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  50.12 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  49.16 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  47.99 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  50.12 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  48.92 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  46.9 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  48.67 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  47.29 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  47.76 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  48.35 
 
 		 444 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  47.27 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  46.82 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  46.95 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  46.93 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  47.29 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.22 
 
 		 739 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  48.34 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.65 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  45.89 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  44.55 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  46.76 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  47.18 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  49.4 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  45.89 
 
 		 443 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  48.33 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  47.06 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  44.37 
 
 		 439 aa  378  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.14 
 
 		 731 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>