196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0940 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 442 aa  894    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  61.99 
 
 		 441 aa  536  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  54.98 
 
 		 442 aa  514  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  53.36 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  54.52 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  52.52 
 
 		 444 aa  482  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  52.48 
 
 		 441 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  32.66 
 
 		 481 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  30.44 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  29.91 
 
 		 480 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  27.53 
 
 		 483 aa  190  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  26.97 
 
 		 501 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  25.66 
 
 		 527 aa  157  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  26.44 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  24.95 
 
 		 651 aa  143  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.92 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  27 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.71 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  26.05 
 
 		 456 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 		 391 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.73 
 
 		 391 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.47 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  30.67 
 
 		 379 aa  97.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  26.96 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 356 aa  94.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  27.98 
 
 		 1153 aa  93.6  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  22.65 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  21.4 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  21.4 
 
 		 395 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  49.38 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  25.65 
 
 		 1096 aa  84.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.75 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  27.47 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 1061 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.65 
 
 		 1061 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.72 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.47 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.22 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.1 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  24.32 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  34.38 
 
 		 792 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.91 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  24.88 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  23.11 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  25.39 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.12 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.9 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  22.88 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  21.96 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.5 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  22.6 
 
 		 1111 aa  63.2  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  27.52 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  24.08 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  22.14 
 
 		 370 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  21.6 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  28.21 
 
 		 1040 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  20.6 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  23.59 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  27 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.16 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  21.83 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  22.39 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  23.44 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  23.44 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.67 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.34 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.45 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  23.41 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  24.82 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  21.88 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.62 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  24.9 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  22.84 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  29.23 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  23.28 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0055  permease YjgP/YjgQ family protein  27.06 
 
 		 449 aa  57  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.853634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>