More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0918 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
144 aa  301  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  65.47 
 
 
151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  62.24 
 
 
145 aa  193  6e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  61.87 
 
 
144 aa  185  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  55.71 
 
 
148 aa  174  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  53.96 
 
 
150 aa  146  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  51.49 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  51.06 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.14 
 
 
146 aa  133  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  50.35 
 
 
164 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.48 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.35 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  51.08 
 
 
144 aa  126  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  47.18 
 
 
142 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  45.71 
 
 
154 aa  122  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  48.48 
 
 
143 aa  122  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  51.91 
 
 
145 aa  120  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  48.61 
 
 
143 aa  120  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  46.9 
 
 
139 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  52.67 
 
 
142 aa  119  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  49.64 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  47.18 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.59 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  48.89 
 
 
142 aa  118  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.76 
 
 
138 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.97 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  48.91 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.88 
 
 
137 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.88 
 
 
139 aa  114  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  44.37 
 
 
143 aa  114  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  47.33 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  43.8 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  42.45 
 
 
144 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  45.04 
 
 
138 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.61 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  44.88 
 
 
127 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  44.2 
 
 
140 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.36 
 
 
137 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  46.27 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  44.44 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  43.38 
 
 
138 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.25 
 
 
143 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  41.91 
 
 
144 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 
144 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.16 
 
 
157 aa  104  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  42.22 
 
 
145 aa  104  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.53 
 
 
137 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.53 
 
 
137 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.08 
 
 
141 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  41.73 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
258 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  42.75 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  39.86 
 
 
134 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  39.86 
 
 
134 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.36 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  39.58 
 
 
134 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  41.01 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  38.89 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  40.88 
 
 
254 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  38.46 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.53 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  38.89 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  40.71 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  36.84 
 
 
188 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  38.19 
 
 
134 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  34.27 
 
 
164 aa  93.6  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 
154 aa  93.6  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  43.9 
 
 
258 aa  93.2  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  38.13 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  38.89 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 
254 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  37.76 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  38.89 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  38.89 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  45.76 
 
 
270 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
255 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  37.76 
 
 
134 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1484  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  43.17 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
269 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  36.69 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  36.62 
 
 
165 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  36.76 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2105  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  41.98 
 
 
588 aa  87.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00514129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
179 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
275 aa  87  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  34.03 
 
 
177 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
171 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  38.73 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  39.42 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  40.6 
 
 
299 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  34.75 
 
 
165 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  36.69 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>