234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0899 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1945  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  92.48 
 
 
360 aa  694    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0899  ATPase  100 
 
 
360 aa  748    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2067  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.67 
 
 
318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2060  ATPase-like protein  40.73 
 
 
330 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.598093  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0586  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.06 
 
 
324 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191514  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  32.64 
 
 
345 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  36.57 
 
 
311 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  33.44 
 
 
291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  34.85 
 
 
278 aa  136  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  36.39 
 
 
292 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3104  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.67 
 
 
343 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  34.08 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2074  ATPase  32.85 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2133  ATPase-like protein  37.22 
 
 
315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170548  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1601  AAA ATPase  34.38 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  34.48 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  34.9 
 
 
281 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1732  ATPase-like protein  31.29 
 
 
350 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0797169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  34.38 
 
 
281 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  31.31 
 
 
284 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  33.98 
 
 
281 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3882  AAA ATPase  33.98 
 
 
372 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50535  normal  0.019718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  33.82 
 
 
278 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  32.91 
 
 
279 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  33.83 
 
 
289 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  33.86 
 
 
281 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  34.25 
 
 
281 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  33.59 
 
 
281 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  34.25 
 
 
281 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  32.09 
 
 
280 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  34.25 
 
 
281 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  31.42 
 
 
284 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  33.09 
 
 
288 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  33.46 
 
 
278 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  34.65 
 
 
281 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  34.25 
 
 
280 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  32.25 
 
 
297 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  34.77 
 
 
281 aa  123  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3905  ATPase, AAA family  34.12 
 
 
281 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.595065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  34.9 
 
 
281 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  33.71 
 
 
277 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  32.64 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  34.12 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.58 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  33.33 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  33.33 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  35.48 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.09 
 
 
281 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  32.33 
 
 
285 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.57 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  33.57 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  33.7 
 
 
279 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
280 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  31.88 
 
 
293 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  32.41 
 
 
301 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  32.71 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  31.6 
 
 
295 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  32.16 
 
 
290 aa  119  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  32.72 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  31.47 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  33.58 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.97 
 
 
282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  35.32 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.94 
 
 
283 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.25 
 
 
282 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  33.2 
 
 
281 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6955  AAA ATPase  30.9 
 
 
373 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2229  ATPase  33.48 
 
 
381 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  33.2 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  35.16 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  34.47 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  32.59 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  30.43 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4307  ATPase  32.4 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0507222  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0437  AAA ATPase  32.55 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.493409  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  33.2 
 
 
284 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  32.16 
 
 
284 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  34.38 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  34.38 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.86 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  34.09 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  34.09 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  34.1 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  34.1 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  32.53 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  33.33 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  34.1 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  34.09 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  34.1 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  32.53 
 
 
280 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  33.86 
 
 
280 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  33.47 
 
 
280 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  33.08 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  35.16 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  35.16 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  35.16 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  31.76 
 
 
284 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  34.38 
 
 
280 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  35.16 
 
 
280 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>