13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0889 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 586 aa  1172    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  63.29 
 
 		 586 aa  771    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1008  polysaccharide biosynthesis protein  69.19 
 
 		 583 aa  828    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314622  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  55.02 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  25.77 
 
 		 938 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 424 aa  54.3  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 501 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 499 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  18.98 
 
 		 519 aa  47.8  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  29.09 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 473 aa  44.3  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 429 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  19.42 
 
 		 514 aa  43.9  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>