More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0831 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
174 aa  350  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  93.68 
 
 
175 aa  332  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  92.53 
 
 
174 aa  331  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  90.23 
 
 
174 aa  329  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  89.08 
 
 
174 aa  317  3.9999999999999996e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  81.03 
 
 
174 aa  298  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  81.03 
 
 
174 aa  297  6e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  51.02 
 
 
167 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
151 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  35.37 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  38.97 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 
160 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 
158 aa  94.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
153 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
159 aa  94.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
160 aa  94.4  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 
143 aa  94.4  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  34.19 
 
 
160 aa  94  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  33.33 
 
 
158 aa  92  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
152 aa  92.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
158 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 
156 aa  91.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
149 aa  91.7  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.78 
 
 
152 aa  91.7  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
148 aa  90.9  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  37.23 
 
 
164 aa  90.9  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  37.23 
 
 
164 aa  90.9  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 
150 aa  90.9  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 
150 aa  90.9  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 
154 aa  90.9  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
145 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
158 aa  90.5  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
152 aa  90.5  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
159 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
156 aa  90.5  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 
157 aa  90.1  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
162 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.17 
 
 
153 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
151 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
145 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
156 aa  88.6  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
150 aa  88.2  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 
151 aa  87.8  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 
171 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  32.93 
 
 
166 aa  87.8  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
157 aa  87.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
156 aa  87.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
149 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  30.64 
 
 
163 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  29.53 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  29.53 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 
144 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  33.56 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  35.2 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  29.53 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  33.56 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
144 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  29.79 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>