More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0812 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  1.22435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  72.55 
 
 
204 aa  301  3e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  71.35 
 
 
202 aa  287  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  64.71 
 
 
206 aa  270  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  65.2 
 
 
206 aa  266  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  65.2 
 
 
206 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  44.32 
 
 
221 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  43.43 
 
 
223 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.44 
 
 
201 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  41.07 
 
 
198 aa  148  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  43.18 
 
 
220 aa  147  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  46.05 
 
 
220 aa  147  1e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  42.69 
 
 
219 aa  147  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  42.46 
 
 
219 aa  147  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  46.05 
 
 
220 aa  147  1e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  46.05 
 
 
220 aa  147  1e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  42.69 
 
 
219 aa  147  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  42.69 
 
 
219 aa  147  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  42.69 
 
 
219 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  42.6 
 
 
217 aa  146  2e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  43.58 
 
 
221 aa  146  2e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  42.69 
 
 
219 aa  145  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  42.69 
 
 
219 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.69 
 
 
219 aa  145  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  42.61 
 
 
219 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  42.69 
 
 
219 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  43.18 
 
 
220 aa  145  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  42.69 
 
 
219 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  42.69 
 
 
219 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  42.78 
 
 
213 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  42.11 
 
 
219 aa  144  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  42.11 
 
 
219 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  45.61 
 
 
221 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  41.41 
 
 
216 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  45.61 
 
 
221 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  41.52 
 
 
219 aa  140  1e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  43.72 
 
 
216 aa  139  2e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  42.01 
 
 
222 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  42.46 
 
 
232 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  37.89 
 
 
220 aa  138  5e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  43.11 
 
 
237 aa  138  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  42.25 
 
 
256 aa  137  8e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  42.63 
 
 
227 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  36.31 
 
 
219 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  48.91 
 
 
262 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  36.27 
 
 
268 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  44.83 
 
 
215 aa  134  1e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  46 
 
 
224 aa  134  1e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  43.53 
 
 
213 aa  133  2e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  46 
 
 
214 aa  133  2e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  42.51 
 
 
219 aa  133  2e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  36.93 
 
 
221 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  39.15 
 
 
259 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.16146e-09 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  40.91 
 
 
237 aa  132  4e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  44.38 
 
 
253 aa  132  4e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  40.86 
 
 
218 aa  132  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  46.55 
 
 
215 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  40.56 
 
 
213 aa  131  7e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  40.26 
 
 
237 aa  131  8e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  2.35996e-05 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
221 aa  131  8e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  40 
 
 
229 aa  130  1e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  39.23 
 
 
218 aa  130  1e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  39.36 
 
 
212 aa  130  1e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  35.87 
 
 
363 aa  129  2e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  41.85 
 
 
223 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  42.17 
 
 
214 aa  129  4e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  44.97 
 
 
226 aa  128  5e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  44.97 
 
 
226 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  44.97 
 
 
226 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  44.97 
 
 
226 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  40.94 
 
 
215 aa  128  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  40.94 
 
 
215 aa  128  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42104e-05 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  44.97 
 
 
226 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  44.97 
 
 
242 aa  127  8e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  44.97 
 
 
283 aa  127  9e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  40.88 
 
 
219 aa  127  9e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  40.51 
 
 
202 aa  126  2e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  44.83 
 
 
215 aa  127  2e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  42.59 
 
 
219 aa  126  2e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  44.83 
 
 
215 aa  127  2e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  46.78 
 
 
216 aa  126  2e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  41.08 
 
 
222 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  38.12 
 
 
215 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  40.66 
 
 
230 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  39.27 
 
 
249 aa  125  4e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  41.85 
 
 
223 aa  125  4e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  39.04 
 
 
244 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  40.67 
 
 
211 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  40.76 
 
 
229 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  42.16 
 
 
277 aa  124  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  39.87 
 
 
202 aa  124  8e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  39.64 
 
 
213 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  40.1 
 
 
216 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  44.76 
 
 
234 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  37.57 
 
 
215 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.88 
 
 
458 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  37.43 
 
 
220 aa  123  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  38.5 
 
 
227 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  39.39 
 
 
245 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  38.99 
 
 
220 aa  121  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>