More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0713 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  293  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  88.97 
 
 
145 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  89.66 
 
 
145 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  44.74 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  42 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  46.36 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  40.67 
 
 
150 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  42.95 
 
 
152 aa  114  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  39.44 
 
 
153 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  38.82 
 
 
152 aa  104  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  44.3 
 
 
155 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  40.79 
 
 
212 aa  100  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  36.18 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  39.04 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  33.78 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  35.17 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  37.67 
 
 
162 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  38.62 
 
 
154 aa  90.1  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  37.58 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  38.1 
 
 
304 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.07 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  38.36 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  36.17 
 
 
390 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
145 aa  87  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  37.84 
 
 
149 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  38.89 
 
 
162 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.43 
 
 
159 aa  86.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  37.5 
 
 
320 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 
162 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  35.42 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.17 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  32.89 
 
 
173 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.81 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  33.56 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.97 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  34.29 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  34.03 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  34.29 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  33.57 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36.36 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.08 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.08 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.39 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  32.87 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.04 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  35.76 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
297 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  34.44 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  37.59 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  34.59 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.76 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  47.06 
 
 
282 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  34.21 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
162 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
148 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 
156 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  31.94 
 
 
276 aa  77  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.35 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  37.76 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  35.37 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  39.44 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.33 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  33.1 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.97 
 
 
290 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 
317 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  34.27 
 
 
325 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  31.97 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  33.33 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.58 
 
 
288 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  34.78 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  34.51 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  33.33 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  34.21 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  35.46 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.92 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.62 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  36.24 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  34.97 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  33.56 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  31.91 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>