More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0710 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  74.1 
 
 		 627 aa  931    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  63.2 
 
 		 616 aa  810    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  62.93 
 
 		 628 aa  815    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  72.58 
 
 		 629 aa  901    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  65.84 
 
 		 628 aa  828    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 631 aa  1293    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  71.45 
 
 		 619 aa  919    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  50.5 
 
 		 615 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  41.67 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  43.06 
 
 		 624 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  40.32 
 
 		 602 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  41.2 
 
 		 598 aa  466  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  41.36 
 
 		 596 aa  467  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  42.22 
 
 		 596 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  41.01 
 
 		 597 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  42.41 
 
 		 598 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  42.43 
 
 		 599 aa  451  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  41.47 
 
 		 604 aa  449  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  40.37 
 
 		 603 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40.79 
 
 		 613 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  40.56 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  39.97 
 
 		 620 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0175  excinuclease ABC, subunit C  39.64 
 
 		 596 aa  435  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  39.81 
 
 		 620 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0477  excinuclease ABC, C subunit  38.56 
 
 		 615 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.966563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 625 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.35 
 
 		 601 aa  428  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  40.03 
 
 		 685 aa  425  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  40.2 
 
 		 591 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.76 
 
 		 615 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  40.22 
 
 		 622 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  39.93 
 
 		 607 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  39.12 
 
 		 653 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  39.34 
 
 		 610 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  40.1 
 
 		 607 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 594 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 594 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 594 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 594 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 		 594 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 607 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  39.81 
 
 		 596 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  38.56 
 
 		 628 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  40.03 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  39.38 
 
 		 594 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  38.59 
 
 		 641 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  39.3 
 
 		 624 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  38.9 
 
 		 593 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  39.16 
 
 		 594 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.35 
 
 		 613 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  39.07 
 
 		 617 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 		 594 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  39.07 
 
 		 617 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  38.41 
 
 		 614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  38.05 
 
 		 669 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 638 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  39.65 
 
 		 613 aa  405  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  39.6 
 
 		 610 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39 
 
 		 590 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  38.69 
 
 		 622 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 		 594 aa  398  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  37.71 
 
 		 665 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  38.28 
 
 		 607 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  37.99 
 
 		 595 aa  396  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  38.36 
 
 		 593 aa  395  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  36.65 
 
 		 640 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  38.25 
 
 		 627 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  37.48 
 
 		 682 aa  393  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  36.91 
 
 		 616 aa  395  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  36.49 
 
 		 640 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 		 669 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 		 649 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 		 599 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.42 
 
 		 613 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  35.9 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  37.82 
 
 		 591 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 658 aa  391  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.83 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  37.54 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 636 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  37.29 
 
 		 641 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  37.26 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  37.84 
 
 		 625 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  35.8 
 
 		 656 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  39.64 
 
 		 614 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 		 593 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  37.04 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 		 593 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 		 666 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 		 674 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  36.38 
 
 		 647 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  38.16 
 
 		 612 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  36.47 
 
 		 644 aa  379  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 520 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  37.28 
 
 		 643 aa  382  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  38.94 
 
 		 619 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  36.44 
 
 		 647 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  36.44 
 
 		 666 aa  379  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  37.31 
 
 		 643 aa  379  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>