14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0683 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  319  1e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  63.75 
 
 
160 aa  211  2e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  2.74795e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  67.08 
 
 
160 aa  204  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  57.23 
 
 
154 aa  182  1e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  69.35 
 
 
178 aa  180  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  3.92175e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2491  hypothetical protein  62.1 
 
 
150 aa  153  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  58.33 
 
 
148 aa  150  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1418  hypothetical protein  44.74 
 
 
145 aa  111  4e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00099  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2148  hypothetical protein  43.48 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  41.59 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1846  hypothetical protein  35 
 
 
147 aa  82.8  2e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1462  hypothetical protein  38.26 
 
 
148 aa  79.3  2e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0573227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1055  hypothetical protein  31.4 
 
 
145 aa  60.5  8e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>