293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0620 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 435 aa  887    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0768  outer membrane efflux protein  74.56 
 
 		 423 aa  608  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  64.35 
 
 		 431 aa  518  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  56.2 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0494  FusA/NodT family protein  52.69 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.690015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  48.56 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  37.9 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.78 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.57 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.56 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.88 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.59 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  25.9 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.23 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  26.49 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.14 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.2 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.66 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.24 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.64 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.02 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  26 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  20.37 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  26 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.11 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  26 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.34 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.62 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.36 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.07 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.7 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.44 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.91 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.43 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.85 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  27.96 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  26.95 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.47 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.47 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2299  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.95 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.05 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  24.91 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.95 
 
 		 469 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.95 
 
 		 469 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.77 
 
 		 496 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.85 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.77 
 
 		 496 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.11 
 
 		 480 aa  57  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.32 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  26.67 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.85 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.03 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.2 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.31 
 
 		 524 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.4 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.87 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.87 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.84 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  24.9 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.49 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.87 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.06 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.66 
 
 		 474 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.64 
 
 		 503 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.65 
 
 		 525 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  22.12 
 
 		 479 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  24.42 
 
 		 509 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.53 
 
 		 471 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.04 
 
 		 533 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.568762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  20.87 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.57 
 
 		 515 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 528 aa  53.5  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  23.33 
 
 		 456 aa  53.5  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.7 
 
 		 456 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  22.67 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.02 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  23.8 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>