293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0620 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  100 
 
 
435 aa  887  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  1.93694e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0768  outer membrane efflux protein  74.56 
 
 
423 aa  608  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  64.35 
 
 
431 aa  518  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  56.2 
 
 
439 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  1.27734e-08  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0494  FusA/NodT family protein  52.69 
 
 
426 aa  400  1e-110  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.690015  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  48.56 
 
 
436 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  37.9 
 
 
438 aa  285  1e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 
419 aa  75.9  1e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.78 
 
 
450 aa  75.5  2e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.57 
 
 
485 aa  71.6  2e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 
419 aa  72  2e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.55286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.56 
 
 
450 aa  70.9  4e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.88 
 
 
497 aa  68.9  1e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.59 
 
 
445 aa  65.5  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 
451 aa  64.7  3e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 
472 aa  64.7  3e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  25.9 
 
 
491 aa  64.3  5e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 
424 aa  63.5  6e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.23 
 
 
482 aa  63.9  6e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  26.49 
 
 
514 aa  63.5  8e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.14 
 
 
452 aa  62.8  1e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.24 
 
 
472 aa  62  2e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  5.96226e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.2 
 
 
457 aa  62  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.02 
 
 
491 aa  62  2e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.64 
 
 
493 aa  61.6  2e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.66 
 
 
489 aa  62  2e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 
446 aa  62  2e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  20.37 
 
 
515 aa  61.2  3e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.99135e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26 
 
 
508 aa  61.2  3e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26 
 
 
508 aa  61.2  3e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  26 
 
 
508 aa  61.2  3e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26 
 
 
508 aa  61.2  3e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.11 
 
 
462 aa  61.6  3e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  26 
 
 
506 aa  61.2  3e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  26 
 
 
508 aa  60.8  4e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 
444 aa  60.8  4e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.34 
 
 
495 aa  60.5  5e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.62 
 
 
485 aa  60.1  7e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.36 
 
 
463 aa  60.1  8e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.07 
 
 
430 aa  60.1  8e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.7 
 
 
456 aa  59.3  1e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.44 
 
 
462 aa  59.3  1e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 
436 aa  58.9  2e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.43 
 
 
441 aa  58.2  3e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.91 
 
 
455 aa  58.2  3e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  27.96 
 
 
453 aa  57.4  4e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2299  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 
514 aa  57.8  4e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  26.95 
 
 
469 aa  57.8  4e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.47 
 
 
514 aa  57.8  4e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.85 
 
 
452 aa  57.8  4e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.47 
 
 
514 aa  57.8  4e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.05 
 
 
479 aa  57.4  5e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 
562 aa  57.4  5e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.95 
 
 
469 aa  57.4  5e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  24.91 
 
 
470 aa  57.4  5e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.95 
 
 
469 aa  57  6e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.95 
 
 
469 aa  57  6e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.11 
 
 
480 aa  57  7e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.77 
 
 
496 aa  57  7e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.77 
 
 
496 aa  57  7e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.85 
 
 
452 aa  56.6  7e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  26.67 
 
 
479 aa  56.6  8e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 
479 aa  56.6  8e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 
482 aa  56.6  8e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.85 
 
 
452 aa  56.6  8e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.32 
 
 
457 aa  56.6  8e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 
471 aa  56.6  9e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.03 
 
 
499 aa  56.6  9e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.31 
 
 
524 aa  56.2  1e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.2 
 
 
450 aa  56.2  1e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 
482 aa  56.2  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.4 
 
 
475 aa  56.2  1e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 
482 aa  56.2  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.84 
 
 
479 aa  55.5  2e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.06 
 
 
472 aa  55.1  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.87 
 
 
476 aa  55.5  2e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.87 
 
 
476 aa  55.5  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.49 
 
 
497 aa  55.1  2e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.87 
 
 
476 aa  55.5  2e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  24.9 
 
 
476 aa  55.5  2e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  22.82 
 
 
432 aa  54.7  3e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.65 
 
 
525 aa  54.7  3e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.66 
 
 
474 aa  54.7  3e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.64 
 
 
503 aa  54.7  3e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  22.12 
 
 
479 aa  54.3  4e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.53 
 
 
471 aa  53.9  5e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.04 
 
 
533 aa  53.9  5e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.568762  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  24.42 
 
 
509 aa  53.9  5e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 
444 aa  53.5  6e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  20.87 
 
 
436 aa  53.9  6e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.57 
 
 
515 aa  53.5  7e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 
528 aa  53.5  7e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  23.33 
 
 
456 aa  53.5  8e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.7 
 
 
456 aa  53.5  8e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  22.8 
 
 
436 aa  52.8  1e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  22.67 
 
 
489 aa  53.1  1e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.02 
 
 
494 aa  52.8  1e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.31 
 
 
495 aa  52.8  1e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>