More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0602 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  61.39 
 
 
633 aa  805    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  57.49 
 
 
660 aa  769    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  53.47 
 
 
630 aa  677    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  62.66 
 
 
632 aa  828    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  65.18 
 
 
631 aa  832    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  100 
 
 
636 aa  1314    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  54.32 
 
 
632 aa  711    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.45 
 
 
619 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.41 
 
 
599 aa  342  9e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  38.97 
 
 
656 aa  339  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  39.25 
 
 
588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.99 
 
 
587 aa  331  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  40.65 
 
 
587 aa  330  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  39.72 
 
 
600 aa  327  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  39.44 
 
 
613 aa  324  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  39.81 
 
 
598 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  39.81 
 
 
598 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  39.81 
 
 
598 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  39.81 
 
 
598 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  39.81 
 
 
598 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  39.81 
 
 
598 aa  323  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  39.81 
 
 
598 aa  323  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  39.81 
 
 
598 aa  323  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.51 
 
 
601 aa  323  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  39.81 
 
 
571 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.27 
 
 
601 aa  321  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  40.52 
 
 
704 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  38.95 
 
 
657 aa  318  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  39.67 
 
 
598 aa  318  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  41.31 
 
 
660 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.41 
 
 
582 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  40.14 
 
 
614 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39.34 
 
 
600 aa  309  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.76 
 
 
583 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  38.32 
 
 
653 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  38.37 
 
 
604 aa  306  6e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  37.41 
 
 
593 aa  306  9.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  37.29 
 
 
662 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.99 
 
 
595 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.53 
 
 
584 aa  300  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.94 
 
 
626 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  37.1 
 
 
703 aa  296  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  39.53 
 
 
599 aa  296  9e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  33.44 
 
 
595 aa  296  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.99 
 
 
604 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.88 
 
 
598 aa  294  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  39.49 
 
 
638 aa  293  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  38.64 
 
 
613 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  36.24 
 
 
674 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.41 
 
 
663 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  32.96 
 
 
595 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.18 
 
 
664 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.07 
 
 
588 aa  287  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  36.88 
 
 
673 aa  286  5.999999999999999e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  38.38 
 
 
598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  39.72 
 
 
599 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  36.57 
 
 
663 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  31.11 
 
 
640 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  39.81 
 
 
591 aa  283  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.04 
 
 
655 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  37.53 
 
 
660 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  37.53 
 
 
660 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.64 
 
 
651 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  37.5 
 
 
694 aa  282  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.41 
 
 
652 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  36 
 
 
605 aa  281  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.91 
 
 
604 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  36 
 
 
605 aa  281  4e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  34.13 
 
 
684 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  35.43 
 
 
596 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  36.81 
 
 
660 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  35.12 
 
 
686 aa  279  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  36.57 
 
 
660 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  38 
 
 
656 aa  278  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  33.82 
 
 
611 aa  277  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  36.19 
 
 
605 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  36.34 
 
 
682 aa  276  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  36.53 
 
 
544 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.34 
 
 
605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  37.18 
 
 
609 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  36.69 
 
 
586 aa  274  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  39.62 
 
 
577 aa  274  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  38.38 
 
 
575 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  34.58 
 
 
599 aa  270  5e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  37.77 
 
 
576 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  37.32 
 
 
646 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  37.32 
 
 
646 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  37.58 
 
 
601 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  38.23 
 
 
573 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  38.28 
 
 
574 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  37.91 
 
 
574 aa  267  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  37.67 
 
 
574 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  37.12 
 
 
574 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  37.42 
 
 
575 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  36.45 
 
 
617 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  37.67 
 
 
574 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  32.95 
 
 
610 aa  266  8e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  33.33 
 
 
621 aa  265  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  38.02 
 
 
588 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  30.39 
 
 
617 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>