102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0524 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  343  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  67.74 
 
 
168 aa  220  6e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0461  hypothetical protein  66.47 
 
 
168 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  60.71 
 
 
168 aa  197  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  56.98 
 
 
165 aa  196  9e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0528  hypothetical protein  53.53 
 
 
167 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.94 
 
 
159 aa  124  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.52 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.98 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  37.74 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  39.1 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.83 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.89 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  37.08 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.5 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14761  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.9 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.579827  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  34.21 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48233  predicted protein  37.95 
 
 
270 aa  67.4  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0415142  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0644  hypothetical protein  32.05 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.41 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  40.51 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09601  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.25 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  39.53 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2018  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.568295  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.55 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  34.19 
 
 
167 aa  60.8  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.16 
 
 
212 aa  60.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.86 
 
 
202 aa  58.9  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.45 
 
 
142 aa  58.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.5 
 
 
189 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.5 
 
 
189 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.5 
 
 
189 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.21 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40 
 
 
189 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.79 
 
 
189 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
284 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  37.5 
 
 
273 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  40.34 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.9 
 
 
195 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.59 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.72 
 
 
139 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163139  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2133  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.717642  hitchhiker  0.000108001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  23.49 
 
 
265 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.21 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  37.04 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.54 
 
 
210 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
191 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  36.36 
 
 
245 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.14 
 
 
196 aa  48.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.42 
 
 
213 aa  48.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.05 
 
 
233 aa  48.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  37.35 
 
 
208 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0506  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  33.78 
 
 
98 aa  47.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255044  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.95 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.78 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  34.52 
 
 
243 aa  45.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.04 
 
 
219 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  31.08 
 
 
232 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  22.09 
 
 
256 aa  45.1  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.48 
 
 
218 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.38 
 
 
170 aa  44.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  44.7  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  30.49 
 
 
221 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  22.73 
 
 
267 aa  44.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.12 
 
 
206 aa  44.3  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.95 
 
 
224 aa  44.3  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.71 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.06 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  35.14 
 
 
257 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  35.14 
 
 
257 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.59 
 
 
218 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.86 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.89 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.84 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.59 
 
 
227 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.5 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  35.06 
 
 
279 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  32.5 
 
 
206 aa  42.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  29.17 
 
 
242 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  24.7 
 
 
293 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.29 
 
 
239 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  40.51 
 
 
198 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.4 
 
 
225 aa  42  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  29.63 
 
 
199 aa  41.6  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3999  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.51 
 
 
224 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4073  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.51 
 
 
224 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  28.29 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.86 
 
 
225 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  34.12 
 
 
257 aa  41.6  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.91 
 
 
220 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4833  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 
226 aa  41.2  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.51 
 
 
230 aa  40.8  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.05 
 
 
220 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>