248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0464 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0464  permease  100 
 
 
350 aa  681  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  9.58774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  77.65 
 
 
353 aa  538  1e-152  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  81 
 
 
350 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  76.99 
 
 
341 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  73.57 
 
 
356 aa  502  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  80.25 
 
 
344 aa  496  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  71.34 
 
 
352 aa  482  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  66.38 
 
 
351 aa  451  1e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  59.66 
 
 
345 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  65.74 
 
 
348 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  61.93 
 
 
351 aa  416  1e-115  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  63.34 
 
 
352 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  66.16 
 
 
348 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  59.82 
 
 
352 aa  407  1e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  61.63 
 
 
351 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  64.72 
 
 
377 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  59.82 
 
 
367 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  60.7 
 
 
354 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  61.23 
 
 
354 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  59.82 
 
 
363 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  62.83 
 
 
364 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  61.11 
 
 
330 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  59.57 
 
 
381 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  60.23 
 
 
353 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  56.25 
 
 
353 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  56.98 
 
 
350 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  59.94 
 
 
362 aa  371  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  60.35 
 
 
351 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  62.62 
 
 
366 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  62.3 
 
 
366 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  53.58 
 
 
315 aa  338  9e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  51.09 
 
 
315 aa  334  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  64.53 
 
 
349 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  53.29 
 
 
315 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  51.75 
 
 
315 aa  328  1e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  53.56 
 
 
317 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  52.35 
 
 
315 aa  316  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  51.64 
 
 
349 aa  316  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  50.66 
 
 
324 aa  312  5e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  45.07 
 
 
319 aa  308  8e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  4.63978e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  51.31 
 
 
322 aa  306  5e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  44.51 
 
 
323 aa  303  3e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  50.65 
 
 
315 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  45.81 
 
 
319 aa  299  5e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  46.86 
 
 
318 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  6.95477e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  44.97 
 
 
323 aa  285  6e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  43.05 
 
 
336 aa  284  2e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  46.71 
 
 
349 aa  283  4e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  46.56 
 
 
321 aa  282  7e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  44.3 
 
 
319 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  44.26 
 
 
334 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  44.22 
 
 
331 aa  273  4e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  40.73 
 
 
323 aa  272  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  47.39 
 
 
332 aa  266  3e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  40.31 
 
 
353 aa  266  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  44.51 
 
 
370 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  38.65 
 
 
337 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  41.18 
 
 
331 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  39.55 
 
 
335 aa  256  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  40.56 
 
 
331 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  40.56 
 
 
331 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  40.87 
 
 
331 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  40.56 
 
 
331 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  44.55 
 
 
318 aa  254  2e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  40.25 
 
 
331 aa  254  2e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  41.23 
 
 
331 aa  252  8e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  43.23 
 
 
337 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  37.61 
 
 
332 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  38.24 
 
 
336 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  43.37 
 
 
337 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  9.36228e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  37.61 
 
 
332 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  37 
 
 
332 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  43.38 
 
 
318 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  42.76 
 
 
354 aa  248  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  42.72 
 
 
318 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  43.65 
 
 
337 aa  242  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  38.53 
 
 
328 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  42.67 
 
 
337 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  35.65 
 
 
330 aa  236  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  37.89 
 
 
338 aa  234  2e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.0966e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  35.5 
 
 
338 aa  233  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  37.11 
 
 
371 aa  228  9e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  40.16 
 
 
284 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  39.33 
 
 
332 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  38.6 
 
 
338 aa  223  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  33.77 
 
 
316 aa  196  4e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  35.71 
 
 
318 aa  196  5e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  34.83 
 
 
301 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  37.18 
 
 
318 aa  185  1e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  31.35 
 
 
311 aa  182  8e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.79758e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  33.22 
 
 
308 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  28 
 
 
356 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  4.78015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  31.29 
 
 
332 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  29.76 
 
 
345 aa  164  2e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  1.19775e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  29.79 
 
 
345 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  29.79 
 
 
345 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  28.85 
 
 
316 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  30.43 
 
 
307 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  34.24 
 
 
294 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  29.14 
 
 
306 aa  156  5e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>