More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0460 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  51.13 
 
 
1044 aa  832    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  49.94 
 
 
1186 aa  787    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  49.15 
 
 
1064 aa  762    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  42.18 
 
 
1201 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  43.06 
 
 
923 aa  668    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  44.02 
 
 
1041 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  44.96 
 
 
1053 aa  676    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  46.4 
 
 
1049 aa  724    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  45.69 
 
 
1023 aa  679    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  45.43 
 
 
1007 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  43.69 
 
 
1183 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  45.76 
 
 
1049 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  100 
 
 
965 aa  2002    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  45.6 
 
 
1492 aa  681    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  42.42 
 
 
1044 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  43.35 
 
 
960 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  42.09 
 
 
1581 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  42.97 
 
 
1190 aa  610  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  34.69 
 
 
1200 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  49.25 
 
 
775 aa  244  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  26.48 
 
 
644 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.56 
 
 
908 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  45.29 
 
 
263 aa  124  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  27.33 
 
 
1349 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  25.54 
 
 
1818 aa  115  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  33.21 
 
 
1080 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  41.88 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  27.85 
 
 
1339 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  39.05 
 
 
416 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 
416 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  26.83 
 
 
2194 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  37.65 
 
 
273 aa  108  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  26.32 
 
 
1742 aa  108  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.7 
 
 
1345 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  24.82 
 
 
1148 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.88 
 
 
1067 aa  105  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  39.29 
 
 
614 aa  103  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  27.31 
 
 
783 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  38.75 
 
 
253 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.21 
 
 
951 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.42 
 
 
412 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  26.76 
 
 
1237 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  34.71 
 
 
766 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  27.78 
 
 
957 aa  99  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  21.08 
 
 
951 aa  97.8  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.54 
 
 
439 aa  97.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.85 
 
 
1004 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  35.5 
 
 
417 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.39 
 
 
997 aa  96.3  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  25.36 
 
 
2216 aa  95.9  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  31.2 
 
 
444 aa  94.7  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  36.99 
 
 
487 aa  94.4  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.92 
 
 
798 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  25.44 
 
 
818 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  37.28 
 
 
468 aa  92.8  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  22.04 
 
 
949 aa  92.8  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  35.76 
 
 
263 aa  92.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  32.64 
 
 
444 aa  92  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  29.76 
 
 
437 aa  91.3  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  36.31 
 
 
447 aa  90.9  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  30.57 
 
 
506 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.59 
 
 
888 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  22.38 
 
 
953 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  35.44 
 
 
464 aa  90.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  36.94 
 
 
303 aa  89.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.4 
 
 
1086 aa  89  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  27.27 
 
 
314 aa  88.2  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  35.71 
 
 
433 aa  87.8  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00725  lipoprotein, putative  34.81 
 
 
454 aa  87.8  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  33.15 
 
 
390 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.26 
 
 
805 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  29.02 
 
 
436 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  36.31 
 
 
319 aa  86.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.71 
 
 
887 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 
861 aa  85.9  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  34.66 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  27.24 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  33.68 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  28.73 
 
 
262 aa  85.5  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 
842 aa  85.1  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  33.86 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  38.1 
 
 
852 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 
882 aa  84.7  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  35.1 
 
 
538 aa  84.7  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.9 
 
 
942 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  28.89 
 
 
377 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  26.32 
 
 
1216 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  32.07 
 
 
348 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  28.28 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  30.62 
 
 
344 aa  83.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  42.15 
 
 
311 aa  83.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  28.28 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  35.37 
 
 
304 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  32.07 
 
 
348 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.71 
 
 
293 aa  83.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  28.28 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1155  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 
328 aa  82.8  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0094568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  32.97 
 
 
312 aa  82.8  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  28.15 
 
 
265 aa  82.8  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  42.86 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>