More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0426 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.53 
 
 
612 aa  649    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  54.92 
 
 
614 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.99 
 
 
659 aa  947    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  54.1 
 
 
616 aa  654    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  77.42 
 
 
631 aa  999    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  71.74 
 
 
662 aa  964    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  53.29 
 
 
608 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.87 
 
 
637 aa  651    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  53.29 
 
 
665 aa  643    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.51 
 
 
640 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.38 
 
 
662 aa  1070    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.55 
 
 
660 aa  966    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.2 
 
 
612 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  56.03 
 
 
637 aa  653    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.43 
 
 
652 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.48 
 
 
673 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.42 
 
 
621 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  100 
 
 
652 aa  1328    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  78.15 
 
 
652 aa  1051    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.1 
 
 
643 aa  630  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.93 
 
 
617 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.02 
 
 
635 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  52.37 
 
 
643 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  53.02 
 
 
635 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.18 
 
 
635 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  52.04 
 
 
660 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  51.63 
 
 
658 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
651 aa  627  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 
641 aa  627  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.29 
 
 
635 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.78 
 
 
639 aa  626  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  50.57 
 
 
641 aa  627  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.81 
 
 
671 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.94 
 
 
634 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  51.55 
 
 
647 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  50.73 
 
 
651 aa  623  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  51.47 
 
 
649 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  51.55 
 
 
647 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  51.55 
 
 
647 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  51.39 
 
 
647 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  50.9 
 
 
647 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  51.39 
 
 
644 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.39 
 
 
647 aa  621  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  51.39 
 
 
647 aa  621  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  50.9 
 
 
644 aa  621  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.81 
 
 
676 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  51.23 
 
 
647 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.14 
 
 
637 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  51.39 
 
 
647 aa  621  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  50.9 
 
 
647 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  51.39 
 
 
644 aa  621  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  51.39 
 
 
644 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  51.39 
 
 
647 aa  621  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  51.73 
 
 
647 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  51.39 
 
 
644 aa  621  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.97 
 
 
654 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.72 
 
 
656 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.14 
 
 
647 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.04 
 
 
610 aa  616  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.39 
 
 
650 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.04 
 
 
610 aa  616  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 
611 aa  618  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 
615 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.46 
 
 
614 aa  617  1e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.62 
 
 
647 aa  618  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 
701 aa  616  1e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  50.9 
 
 
659 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 
655 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 
660 aa  614  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  51.23 
 
 
644 aa  615  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  51.14 
 
 
612 aa  612  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.37 
 
 
641 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  50.25 
 
 
650 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  50.66 
 
 
647 aa  609  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.19 
 
 
634 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  51.79 
 
 
660 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.39 
 
 
636 aa  610  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.68 
 
 
672 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
656 aa  609  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  52.89 
 
 
654 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50.49 
 
 
681 aa  608  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 
657 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  50.9 
 
 
649 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
640 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.59 
 
 
648 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
642 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
640 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 
657 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  50.49 
 
 
650 aa  608  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 
642 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 
657 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
657 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.93 
 
 
643 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.65 
 
 
657 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.74 
 
 
657 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  50.97 
 
 
639 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
657 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 
640 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.9 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.41 
 
 
617 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>