45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0396 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  2.19065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  56.92 
 
 
222 aa  249  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.64582e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  51.81 
 
 
229 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  3.21544e-08  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  47.24 
 
 
237 aa  183  2e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.65073e-06  hitchhiker  3.18846e-05 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  41.47 
 
 
234 aa  171  7e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  9.21027e-11  unclonable  2.18864e-06 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  43.19 
 
 
249 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  4.60026e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  43.44 
 
 
194 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  44.21 
 
 
231 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  4.90319e-08  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  38.17 
 
 
227 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  37.9 
 
 
197 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  4.99206e-11  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  35.94 
 
 
227 aa  121  1e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  34.98 
 
 
202 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.93309e-08  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  34.14 
 
 
215 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  2.37774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  31.3 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  33.61 
 
 
206 aa  95.5  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  33.33 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  1.6508e-06  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  30.87 
 
 
212 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  29.96 
 
 
195 aa  90.1  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  9.82114e-11  unclonable  6.60987e-07 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  36.2 
 
 
190 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  4.33571e-07  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  30.95 
 
 
213 aa  85.1  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.66058e-13 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  29.69 
 
 
195 aa  83.2  4e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  28.34 
 
 
183 aa  77.4  2e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  28.51 
 
 
201 aa  77  3e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  29.53 
 
 
224 aa  75.9  6e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  30.59 
 
 
224 aa  75.1  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  27.69 
 
 
190 aa  72.8  4e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  1.02603e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  28.21 
 
 
219 aa  70.1  3e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  29.41 
 
 
222 aa  70.1  3e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  26.59 
 
 
209 aa  65.9  5e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  7.77895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  29.63 
 
 
196 aa  63.9  2e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  5.83804e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  26.75 
 
 
186 aa  61.6  1e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  28.64 
 
 
238 aa  53.9  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 
373 aa  51.2  1e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
380 aa  48.9  7e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 
361 aa  48.9  7e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  27.84 
 
 
359 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  25.38 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  24.07 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  24.07 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  27.68 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  27.68 
 
 
236 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  26.4 
 
 
357 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  23.65 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  23.65 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  23.65 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.408494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>