More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0391 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  100 
 
 
428 aa  874    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  64.13 
 
 
422 aa  542  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  59.95 
 
 
411 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  55.84 
 
 
428 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  54.76 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  52.27 
 
 
436 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  54.18 
 
 
422 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  37.7 
 
 
429 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  36.77 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.9 
 
 
424 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  32.41 
 
 
429 aa  226  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  34.64 
 
 
428 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  34.25 
 
 
428 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  34.55 
 
 
428 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  34.67 
 
 
425 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.56 
 
 
424 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.1 
 
 
433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  34.87 
 
 
429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.03 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  32.4 
 
 
433 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.4 
 
 
433 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  32.4 
 
 
433 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  32.4 
 
 
433 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  32.4 
 
 
433 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 
428 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  32.31 
 
 
459 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  31.64 
 
 
433 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  38.06 
 
 
424 aa  209  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  33.96 
 
 
431 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.86 
 
 
433 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.17 
 
 
433 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.26 
 
 
466 aa  206  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  29.84 
 
 
441 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  33.73 
 
 
424 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  35.47 
 
 
440 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  30.56 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  29.69 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  33.02 
 
 
429 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  32.11 
 
 
408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  35.53 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  30.61 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  35.14 
 
 
433 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  31.87 
 
 
431 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  30.12 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 
431 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.95 
 
 
443 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.8 
 
 
422 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  30.44 
 
 
424 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  35.05 
 
 
426 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  31.47 
 
 
433 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  37.2 
 
 
426 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  35.94 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.19 
 
 
437 aa  190  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  34.82 
 
 
420 aa  190  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
431 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.19 
 
 
435 aa  190  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  28.77 
 
 
404 aa  190  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  32.42 
 
 
427 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  30.89 
 
 
422 aa  189  9e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  36.04 
 
 
444 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 
448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  36.6 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  35.9 
 
 
414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
817 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
423 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  34 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.26 
 
 
416 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.42 
 
 
438 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  34.48 
 
 
448 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  34.05 
 
 
437 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  29.72 
 
 
474 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  31.11 
 
 
438 aa  177  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  34.04 
 
 
435 aa  176  6e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  33.07 
 
 
468 aa  176  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  35.02 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  35.43 
 
 
441 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  30.79 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.78 
 
 
427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  35.32 
 
 
444 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  33.1 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  36.94 
 
 
445 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  34.82 
 
 
404 aa  172  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  34.26 
 
 
441 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  34.26 
 
 
441 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  34.33 
 
 
437 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 
442 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  34.25 
 
 
432 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  30.47 
 
 
435 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  33.81 
 
 
437 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  33.86 
 
 
430 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  31.87 
 
 
442 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 
442 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  31.63 
 
 
430 aa  170  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  34.26 
 
 
441 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  34.82 
 
 
452 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  33.52 
 
 
813 aa  169  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  32.95 
 
 
461 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.18 
 
 
470 aa  169  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>