57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0309 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  55.73 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  48.7 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  43.68 
 
 		 183 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  45.41 
 
 		 195 aa  147  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  44.58 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  43.17 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  43.08 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  44.07 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  38.89 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  38.61 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  39.69 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  42.05 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  33.98 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  29.13 
 
 		 229 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  32.51 
 
 		 219 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  34.87 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  30.6 
 
 		 213 aa  84.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  32.85 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  30.73 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  30.4 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  30.13 
 
 		 237 aa  80.9  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  28.91 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  28.05 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  31.86 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  27.69 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  32.12 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  30.72 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  27.23 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  30.63 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  27.31 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  29.25 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  28.57 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  32.35 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1226  hypothetical protein  31.36 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  34 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  34 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  33.33 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  34 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  30.12 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  25.12 
 
 		 373 aa  48.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_002978  WD1063  surface antigen Wsp  33.07 
 
 		 237 aa  47.8  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00212087  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  27.97 
 
 		 359 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  36.78 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3066  porin opacity type  30.99 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0863  outer surface protein  35.05 
 
 		 284 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0348561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0921  outer surface protein  35.05 
 
 		 284 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.470956  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4728  heat resistant agglutinin 1  30.65 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  32.14 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  28.77 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  28.77 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4111  hypothetical protein  30.89 
 
 		 274 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.298629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2558  hypothetical protein  28.33 
 
 		 283 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00491481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3912  hypothetical protein  30.32 
 
 		 280 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12641  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.536745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  25.85 
 
 		 373 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1309  hypothetical protein  29.68 
 
 		 266 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474929  normal  0.188367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>