More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0301 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  73.38 
 
 		 755 aa  1148    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 760 aa  1571    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  73.86 
 
 		 752 aa  1143    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  76.15 
 
 		 762 aa  1129    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  62.75 
 
 		 750 aa  950    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  62.61 
 
 		 774 aa  961    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  79.04 
 
 		 730 aa  1232    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  40.03 
 
 		 783 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  41.06 
 
 		 742 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  36.08 
 
 		 762 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  37.81 
 
 		 743 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  38.06 
 
 		 740 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  40.45 
 
 		 743 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  40.45 
 
 		 743 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  38.92 
 
 		 743 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  38.13 
 
 		 794 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  37.02 
 
 		 786 aa  436  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  39.33 
 
 		 787 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 		 768 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  40.5 
 
 		 801 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  39.55 
 
 		 838 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  36.32 
 
 		 772 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.66 
 
 		 834 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  38.76 
 
 		 857 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  38.86 
 
 		 870 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  39.1 
 
 		 857 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  38.46 
 
 		 862 aa  425  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  38.78 
 
 		 826 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  37.71 
 
 		 765 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  39.1 
 
 		 857 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 839 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 844 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  38.91 
 
 		 810 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 844 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 839 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 928 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 844 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 844 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  39.23 
 
 		 787 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 		 841 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  38.83 
 
 		 858 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  36.55 
 
 		 759 aa  422  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  39.7 
 
 		 728 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  38.98 
 
 		 888 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 		 821 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  39.39 
 
 		 732 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  36.36 
 
 		 785 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.35 
 
 		 907 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.86 
 
 		 767 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  37.46 
 
 		 854 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  38.12 
 
 		 850 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  36.31 
 
 		 776 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  34.82 
 
 		 850 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.91 
 
 		 846 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  39.07 
 
 		 846 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  34.1 
 
 		 773 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 686 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 		 846 aa  389  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  36.09 
 
 		 795 aa  389  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  33.46 
 
 		 815 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 678 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  37.1 
 
 		 698 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  36.28 
 
 		 675 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  33.07 
 
 		 786 aa  359  9e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  32.74 
 
 		 802 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  33.15 
 
 		 748 aa  356  8.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.28 
 
 		 648 aa  356  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  34.65 
 
 		 793 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 796 aa  352  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 773 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  37.22 
 
 		 709 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  32.81 
 
 		 806 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  37.22 
 
 		 709 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  37.22 
 
 		 709 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.95 
 
 		 765 aa  348  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  35.22 
 
 		 727 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  36.91 
 
 		 707 aa  346  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 		 713 aa  346  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 		 713 aa  346  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  34.78 
 
 		 797 aa  346  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 		 713 aa  346  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  31.48 
 
 		 809 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 		 705 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  33.56 
 
 		 791 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 713 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 713 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 713 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 714 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.49 
 
 		 648 aa  343  5.999999999999999e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  30.7 
 
 		 793 aa  343  7e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  30.85 
 
 		 817 aa  343  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  32.41 
 
 		 804 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  35.32 
 
 		 710 aa  342  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  32.63 
 
 		 797 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  30.57 
 
 		 793 aa  341  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.74 
 
 		 646 aa  340  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  31.73 
 
 		 805 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  31.59 
 
 		 805 aa  340  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  36.57 
 
 		 776 aa  340  8e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  33.29 
 
 		 777 aa  339  9e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>