More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0230 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  100 
 
 
229 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  83.84 
 
 
229 aa  401  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  1.03528e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2682  50S ribosomal protein L1  92.14 
 
 
229 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  2.86692e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  88.65 
 
 
229 aa  399  1e-110  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.25522e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  87.34 
 
 
229 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  79.48 
 
 
229 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  79.04 
 
 
229 aa  361  6e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  1.05773e-08  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  59.29 
 
 
231 aa  284  8e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 
232 aa  280  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  5.01108e-06  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  59.28 
 
 
232 aa  276  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  59.01 
 
 
232 aa  273  1e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  57.99 
 
 
235 aa  272  4e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  57.73 
 
 
231 aa  271  8e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  60.27 
 
 
238 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  56.31 
 
 
236 aa  269  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  56 
 
 
233 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  5.73906e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  56 
 
 
233 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  3.86293e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3172  50S ribosomal protein L1  58.11 
 
 
232 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  56 
 
 
233 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  58.9 
 
 
238 aa  269  3e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  58.45 
 
 
234 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17065e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  58.45 
 
 
234 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  57.6 
 
 
229 aa  264  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.56 
 
 
230 aa  264  9e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.27232e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  58.15 
 
 
232 aa  263  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  55.71 
 
 
236 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  53.1 
 
 
234 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 
230 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  6.9455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 
230 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  3.52195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  57.73 
 
 
233 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.32548e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0846  50S ribosomal protein L1  57.73 
 
 
232 aa  262  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.408948 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0423  50S ribosomal protein L1  57.53 
 
 
229 aa  262  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  3.83524e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  55.45 
 
 
233 aa  262  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  57.99 
 
 
233 aa  260  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 
233 aa  259  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  56.82 
 
 
234 aa  259  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.53 
 
 
233 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  55.61 
 
 
238 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 
232 aa  259  3e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 
233 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 
230 aa  258  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  57.92 
 
 
235 aa  258  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  54.79 
 
 
236 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  54.79 
 
 
232 aa  256  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  53.42 
 
 
241 aa  256  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  52.38 
 
 
235 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  53.81 
 
 
236 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 
231 aa  255  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  51.11 
 
 
233 aa  254  7e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  54.46 
 
 
233 aa  254  9e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  53.64 
 
 
225 aa  254  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  58.82 
 
 
230 aa  254  1e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.85888e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  55.71 
 
 
233 aa  254  1e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  56.16 
 
 
233 aa  253  2e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  56.28 
 
 
232 aa  252  3e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  56.16 
 
 
233 aa  252  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  52.02 
 
 
233 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  2.40107e-13  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  53.18 
 
 
234 aa  252  4e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  54.09 
 
 
235 aa  251  5e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.74523e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  50 
 
 
235 aa  251  6e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  52.91 
 
 
238 aa  251  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  53.64 
 
 
234 aa  251  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  54.26 
 
 
238 aa  251  8e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  54.87 
 
 
230 aa  249  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.51678e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  52.97 
 
 
239 aa  249  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  53.81 
 
 
242 aa  249  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1707  50S ribosomal protein L1  54.05 
 
 
229 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  56.36 
 
 
230 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.40164e-08  unclonable  7.07039e-26 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 
229 aa  248  5e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  52.68 
 
 
242 aa  248  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.26656e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  51.14 
 
 
230 aa  248  6e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 
230 aa  246  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.39498e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 
230 aa  246  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  6.78721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  55.45 
 
 
230 aa  246  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.71982e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 
233 aa  247  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.44477e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 
230 aa  246  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.05875e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 
230 aa  246  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.43327e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 
230 aa  246  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 
230 aa  246  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 
230 aa  246  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.82446e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 
230 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.53199e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  52.97 
 
 
259 aa  245  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  55.45 
 
 
235 aa  245  5e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  56.11 
 
 
229 aa  245  5e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 
231 aa  245  5e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.27574e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  53.33 
 
 
229 aa  244  7e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.98509e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  56.56 
 
 
229 aa  244  7e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0178  50S ribosomal protein L1  58.06 
 
 
233 aa  244  1e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0966549  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  52.27 
 
 
235 aa  243  1e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  6.49528e-09  unclonable  2.62625e-08 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  52.21 
 
 
231 aa  243  1e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  55 
 
 
231 aa  243  2e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  56.94 
 
 
231 aa  243  2e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  51.14 
 
 
237 aa  243  2e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  55.91 
 
 
238 aa  242  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 
230 aa  242  4e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  54.63 
 
 
234 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  55.45 
 
 
230 aa  241  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.4838e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  54.63 
 
 
234 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  54.63 
 
 
234 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  54.75 
 
 
234 aa  240  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>