42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0227 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
63 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  85.71 
 
 
63 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  85.71 
 
 
63 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  80.95 
 
 
63 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  85.71 
 
 
63 aa  107  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0313  preprotein translocase subunit SecE  63.49 
 
 
63 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123291  decreased coverage  0.0000997668 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  60.32 
 
 
63 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  45.61 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  36.73 
 
 
84 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  30.65 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  31.48 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.07 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  36.73 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0267  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  39.62 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0300363  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
87 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0238  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  38.3 
 
 
65 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.35 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.04 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  35.59 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0684  preprotein translocase, SecE subunit  32.61 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000000414413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2548  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 
59 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  26.32 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  26.32 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  40.48 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  45.65 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
123 aa  40  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>