162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0084 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  988    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  72.78 
 
 
486 aa  736    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  65.9 
 
 
487 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  56.86 
 
 
543 aa  362  9e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  56.52 
 
 
543 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  37.84 
 
 
477 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  35.61 
 
 
477 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1917  hypothetical protein  55.97 
 
 
134 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.22 
 
 
476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.44 
 
 
486 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.25 
 
 
485 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  26.29 
 
 
435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.18 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  24.66 
 
 
388 aa  103  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  27.27 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  25.94 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  24.41 
 
 
392 aa  94  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0058  hypothetical protein  82.35 
 
 
59 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00607062  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  25.67 
 
 
410 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  25.07 
 
 
462 aa  89.4  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  24.26 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  26.98 
 
 
428 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  24.26 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  23.1 
 
 
427 aa  86.7  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  27.06 
 
 
425 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  23.86 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  23.06 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  26.08 
 
 
428 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  27.24 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  28.85 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  25.97 
 
 
418 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  25.69 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  28.43 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  29.26 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  27.4 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  25.45 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  26.22 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  25.53 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  25.48 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  24.29 
 
 
417 aa  77  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  25.9 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  26.42 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  25.33 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.86 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  23.4 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  22.31 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  27.37 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  24.02 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  25.9 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.34 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  25.26 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  26.48 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  27.41 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  25.53 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  21.74 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  25.8 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  21.84 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  25.79 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0961  hypothetical protein  23.51 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416068  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  25.54 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  25.3 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  25.26 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  24.77 
 
 
434 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.31 
 
 
378 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.55 
 
 
430 aa  66.6  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  24.7 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  25.66 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  23.57 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  30.05 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  26.19 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  23.53 
 
 
474 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  29.94 
 
 
196 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4144  AAA ATPase  25.75 
 
 
429 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  21.05 
 
 
385 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  24.11 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  25.62 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  26.78 
 
 
360 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  25.54 
 
 
408 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  26.43 
 
 
388 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  25.87 
 
 
421 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  34.06 
 
 
542 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  25.96 
 
 
437 aa  64.3  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  23.2 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  22.28 
 
 
427 aa  64.3  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  22.28 
 
 
427 aa  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  24.27 
 
 
501 aa  63.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.26 
 
 
376 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  24.46 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  23.65 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  26.26 
 
 
392 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  22.85 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  23.45 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  23.45 
 
 
420 aa  63.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  25.11 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.75 
 
 
377 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  22.41 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  26.01 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  25 
 
 
418 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  23.34 
 
 
390 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  25.96 
 
 
465 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>