28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0070 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0070  CopG family protein  100 
 
 
75 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2830  helix-turn-helix protein, CopG family  82.19 
 
 
79 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1716  helix-turn-helix protein, CopG family  80 
 
 
75 aa  122  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0451  CopG family protein  69.44 
 
 
87 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0580  hypothetical protein  68.06 
 
 
74 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1724  CopG family protein  68.06 
 
 
78 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.142369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0411  CopG family protein  68.06 
 
 
77 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2524  hypothetical protein  60.53 
 
 
86 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2747  hypothetical protein  57.89 
 
 
90 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.123898  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0077  hypothetical protein  59.46 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0084  hypothetical protein  56.58 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1718  CopG family protein  54.79 
 
 
75 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0621  hypothetical protein  51.35 
 
 
75 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.206536  normal  0.792782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0606  hypothetical protein  52.7 
 
 
75 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1640  hypothetical protein, putative phage gene  64.79 
 
 
81 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0227  hypothetical protein  52.86 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127505  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0446  hypothetical protein  47.3 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000515088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0696  hypothetical protein  52.78 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0101984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2001  CopG family protein  48 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.322233  hitchhiker  0.000000165214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1495  CopG family protein  47.3 
 
 
80 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.328754 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1779  helix-turn-helix protein, CopG family  41.89 
 
 
82 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.44193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0434  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  41.1 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1133  hypothetical protein  31.94 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06670  hypothetical protein  44.19 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00382876  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1395  hypothetical protein  30.99 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0291  hypothetical protein  28.57 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3296  hypothetical protein  28.21 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.790615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2134  hypothetical protein  30.67 
 
 
85 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00517291  normal  0.0289153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>