216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0047 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  100 
 
 		 323 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  66.67 
 
 		 320 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  67.08 
 
 		 322 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  64.56 
 
 		 316 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  62.46 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  55.7 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  53.92 
 
 		 316 aa  315  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  40 
 
 		 357 aa  209  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1397  L,D-carboxypeptidase A  40.06 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.61 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1332  L,D-carboxypeptidase A  39.74 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.25727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1452  L,D-carboxypeptidase A  38.39 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.85 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  41.64 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.33 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  38.72 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.15 
 
 		 316 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  37.38 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  38.38 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  38.64 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  35.71 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  36.01 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1513  L,D-carboxypeptidase A  36.14 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2537  L,D-carboxypeptidase A  36.14 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3298  L,D-carboxypeptidase A  36.14 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.968546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2393  L,D-carboxypeptidase A  36.14 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2436  L,D-carboxypeptidase A  36.14 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0765003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1284  L,D-carboxypeptidase A  36.14 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.017438  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2360  L,D-carboxypeptidase A  36.14 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  37.14 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1574  L,D-carboxypeptidase A  35.31 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  35.1 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5282  L,D-carboxypeptidase A  35.1 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.93 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  36.89 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2012  L,D-carboxypeptidase A  35.83 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  34.44 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  34.77 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  34.44 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.31 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  36.89 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.94 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2063  L,D-carboxypeptidase A  35.08 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  34.52 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.1 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  36.51 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1998  L,D-carboxypeptidase A  34.39 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.19 
 
 		 312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  36.15 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1333  L,D-carboxypeptidase A  34.04 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  36.93 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1518  L,D-carboxypeptidase A  34.04 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.53 
 
 		 348 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1938  L,D-carboxypeptidase A  34.04 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1955  L,D-carboxypeptidase A  34.38 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  36.25 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  36.93 
 
 		 293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.24 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  35.6 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01167  L,D-carboxypeptidase A  34.74 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.187691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2456  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.74 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  35.28 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  35.6 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  35.28 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.15 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01177  hypothetical protein  34.74 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2433  L,D-carboxypeptidase A  34.74 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.383689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1296  L,D-carboxypeptidase A  34.74 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0534846  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1942  L,D-carboxypeptidase A  33.68 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1350  L,D-carboxypeptidase A  35.09 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1337  L,D-carboxypeptidase A  34.74 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  35.28 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.62 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  35.28 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1679  L,D-carboxypeptidase A  35.09 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000833472  normal  0.396498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1956  L,D-carboxypeptidase A  34.04 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0449281  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  32.59 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.58 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  33.12 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.9 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.75 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.7 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.12 
 
 		 305 aa  149  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  33.12 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.44 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5613  hypothetical protein  33.12 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  31.79 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5487  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.76 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.46 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.73 
 
 		 309 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  33.12 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.81 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.91 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  32.48 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.81 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1821  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.77 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87713  hitchhiker  0.00000133837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4303  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.89 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.229564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3081  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.42 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.060075  normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3880  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.53 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>