More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0040 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  82.06 
 
 		 570 aa  906    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  86.49 
 
 		 566 aa  952    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  85.64 
 
 		 570 aa  980    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  82.56 
 
 		 568 aa  959    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  87.8 
 
 		 562 aa  993    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  81.34 
 
 		 551 aa  913    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  100 
 
 		 565 aa  1155    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  39.16 
 
 		 520 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  37.28 
 
 		 516 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  39.01 
 
 		 535 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  38.22 
 
 		 504 aa  362  8e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  38.35 
 
 		 520 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  36.2 
 
 		 543 aa  342  9e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  38.08 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  35.83 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  36.84 
 
 		 516 aa  334  3e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  34.55 
 
 		 516 aa  333  4e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  44.71 
 
 		 604 aa  327  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  36.7 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  35.28 
 
 		 543 aa  312  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  38.37 
 
 		 530 aa  303  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  36.79 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  35.81 
 
 		 503 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  34.64 
 
 		 494 aa  300  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  32.54 
 
 		 512 aa  300  5e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  36.4 
 
 		 496 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  36.52 
 
 		 531 aa  299  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  36.03 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  33.21 
 
 		 559 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  33.21 
 
 		 496 aa  290  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  33.21 
 
 		 496 aa  290  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  36.99 
 
 		 503 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  32.27 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  32.44 
 
 		 515 aa  287  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  34.71 
 
 		 562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  36.81 
 
 		 507 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  34.89 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  35.99 
 
 		 500 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  33.08 
 
 		 487 aa  281  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  34.32 
 
 		 564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  35.37 
 
 		 792 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  38.02 
 
 		 1031 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  33.78 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  34.62 
 
 		 537 aa  273  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  34.18 
 
 		 636 aa  272  9e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1711  ribonuclease E  32.77 
 
 		 868 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296054  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  33.64 
 
 		 496 aa  272  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  33.54 
 
 		 528 aa  270  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  33.93 
 
 		 497 aa  270  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  33.08 
 
 		 488 aa  270  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  33.13 
 
 		 528 aa  269  8e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2131  RNAse E  31.22 
 
 		 936 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162164  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0806  ribonuclease  31.22 
 
 		 890 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0942815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  33.01 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  33.01 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  35.42 
 
 		 919 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4398  ribonuclease G  33.58 
 
 		 500 aa  266  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  35.29 
 
 		 903 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  33.77 
 
 		 500 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  33.02 
 
 		 489 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  34.53 
 
 		 808 aa  264  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  32.84 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  32.84 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  32.84 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  32.84 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  32.84 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  35.09 
 
 		 490 aa  264  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  35.58 
 
 		 806 aa  263  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  32.96 
 
 		 502 aa  263  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  32.53 
 
 		 502 aa  263  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  33.15 
 
 		 489 aa  263  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  41.41 
 
 		 702 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  34.88 
 
 		 1073 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0738  ribonuclease  37.53 
 
 		 740 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  32.84 
 
 		 489 aa  260  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  39.59 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  32.46 
 
 		 489 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  32.65 
 
 		 489 aa  260  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  33.33 
 
 		 926 aa  259  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  32.65 
 
 		 489 aa  259  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  32.65 
 
 		 489 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  32.65 
 
 		 489 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  33.46 
 
 		 488 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0731  ribonuclease, Rne/Rng family  38.56 
 
 		 860 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.767786  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  33.65 
 
 		 488 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0732  ribonuclease, Rne/Rng family  38.56 
 
 		 844 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  32.59 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  32.46 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1776  ribonuclease E  32.22 
 
 		 984 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000943072  decreased coverage  0.00020345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  34.03 
 
 		 866 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  33.14 
 
 		 502 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  32.95 
 
 		 571 aa  257  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  33.21 
 
 		 502 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  33.21 
 
 		 502 aa  257  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3750  ribonuclease G  33.58 
 
 		 502 aa  256  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.580214  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  31.72 
 
 		 489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  31.72 
 
 		 489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  36.82 
 
 		 1102 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  31.72 
 
 		 489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  31.72 
 
 		 489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>