More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0038 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  100 
 
 		 205 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  69.76 
 
 		 206 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  70.73 
 
 		 299 aa  289  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  63.41 
 
 		 206 aa  258  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  60.29 
 
 		 207 aa  255  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  62.44 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  62.93 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48.37 
 
 		 198 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  50 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  178  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  48.72 
 
 		 338 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  50 
 
 		 268 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 283 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 283 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  57.53 
 
 		 196 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  52.72 
 
 		 191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.4 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  49.73 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  51.35 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.81 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  50.81 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  49.18 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 197 aa  168  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  49.73 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  50 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  48.94 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  46.94 
 
 		 203 aa  167  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  48.68 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  51.65 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  48.68 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  47.57 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  48.15 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  45.45 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  47.85 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  50 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  50.8 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  45.9 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  45.5 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1094  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  43.6 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  45.92 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  43.62 
 
 		 221 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  50.51 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  45.31 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  45.88 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  43.59 
 
 		 253 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  48.76 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  44.85 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  44.72 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  48.94 
 
 		 240 aa  158  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  49.45 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 257 aa  158  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  49.49 
 
 		 257 aa  158  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  49.18 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  50 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  45.13 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>