13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0013 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0013  transposase  100 
 
 
230 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1754  hypothetical protein  98.7 
 
 
230 aa  471  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1970  hypothetical protein  98.7 
 
 
230 aa  471  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2322  hypothetical protein  97.39 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.129316  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0332  transposase  86.52 
 
 
230 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2621  hypothetical protein  56 
 
 
97 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1507  transposase family protein  27.85 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2310  transposase family protein  27.85 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1107  transposase  28.65 
 
 
549 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.373309  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2905  transposase  28.22 
 
 
544 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4884  hypothetical protein  45.95 
 
 
94 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0018  transposase  25.89 
 
 
376 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3065  transposase  25.36 
 
 
444 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>