240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2033 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
221 aa  462  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  69.68 
 
 
221 aa  330  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  69.68 
 
 
221 aa  320  9.000000000000001e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  66.82 
 
 
222 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  65.16 
 
 
221 aa  302  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  63.8 
 
 
221 aa  300  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  63.8 
 
 
220 aa  295  3e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  59.01 
 
 
223 aa  271  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  59.28 
 
 
222 aa  263  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  56.11 
 
 
224 aa  258  4e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 
231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  54.75 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  53.85 
 
 
230 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 
231 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  53.85 
 
 
229 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
241 aa  251  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  53.85 
 
 
230 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  54.09 
 
 
233 aa  249  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 
230 aa  247  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 
230 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 
233 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  52.49 
 
 
230 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 
225 aa  245  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  52 
 
 
261 aa  245  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  52.27 
 
 
235 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 
230 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  52.56 
 
 
229 aa  244  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  57.69 
 
 
218 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  53.74 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  52.49 
 
 
223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
231 aa  241  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 
269 aa  238  8e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 
225 aa  237  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  54.88 
 
 
225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 
231 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  51.13 
 
 
225 aa  234  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 
240 aa  234  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
230 aa  234  9e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  51.87 
 
 
224 aa  232  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  54.09 
 
 
231 aa  232  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  51.87 
 
 
243 aa  232  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 
235 aa  232  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 
223 aa  232  3e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
229 aa  230  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 
225 aa  230  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
241 aa  228  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  51.36 
 
 
232 aa  228  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  52.11 
 
 
218 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  52.11 
 
 
218 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
229 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 
228 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  54.17 
 
 
229 aa  226  2e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  47.89 
 
 
232 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 
226 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 
217 aa  225  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  48.42 
 
 
225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  48.42 
 
 
225 aa  224  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  47.93 
 
 
233 aa  224  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
225 aa  224  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  51.13 
 
 
226 aa  224  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  48.86 
 
 
245 aa  222  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 
225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
245 aa  221  9e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  49.1 
 
 
247 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 
225 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 
222 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  49.77 
 
 
244 aa  220  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  48.87 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
225 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  51.11 
 
 
231 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
253 aa  218  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 
221 aa  218  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  48.83 
 
 
228 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
231 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
223 aa  216  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
226 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  48.85 
 
 
227 aa  216  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
231 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
228 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 
229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
229 aa  215  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  47.2 
 
 
225 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
229 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
229 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
229 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
229 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 
228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  46.61 
 
 
222 aa  214  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  47.2 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 
225 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
226 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  47.2 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  48.42 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>